当前位置: 首页 > 计算模拟 >compass力场介绍

compass力场介绍

作者 dongping001
来源: 小木虫 550 11 举报帖子
+关注

COMPASS一词出自Condensed-phase Optimized Molecular Potentials for Atomistic Simulation Studies.这是第一个出自量子力学从头计算的力场。该力场不但能够模拟孤立分子的结构、振动频率、热力学性质等,重要的是它能够模拟出更准确的凝聚态的结构与性质。后者是以往的分子力场所不及的,因为一般分子力场中非键合项的原子对势函数以及力常数是从单原子分子体系的数据组合而来的,并未做更严格的考核。而在COMPASS中不同了,非键相互作用势函数与力常数是在分子动力学模拟分子液体与晶体中不断优化出来的。另外,MM2、DREIDING,UFF等力场的振动频率计算结果误差很大,一般平均超过100cm-1,对于键角弯曲振动峰要差到200cm-1以上。在COMPASS中该误差已降到30-50 cm-1。
为了得到对势能面更加准确的描述,COMPASS采用更加复杂的一套势能函数。其函数形式与CFF力场是一致的,即采用级数展开达三项的形式。如健伸缩能
      Eb=k2(b-b0)2+k3(b-b0)3+k4 (b-b0)4
还有键角弯曲能、扭转能都采取三项加和三个力常数。除了一般的面外弯曲能外,该分子力场增加了大量的交叉项,包括:键伸缩/键伸缩, 键伸编/键角弯曲,键伸缩/扭转,键角弯曲/扭转,键角弯曲/键角弯曲等能量项。对于非键合能量项部分,不同之处在于范德华能采用Lennard-Jones-9-6函数 返回小木虫查看更多

今日热帖
  • 精华评论
  • yalefield

    问题是没有抄完啊.
    正拉着半截,打铃了......

  • dongping001

    确实是杨老师的那本书的,因为忘了书名就没有标上,这部分内容是对分子力学的补充,分子力学的核心是力场,杨老师在n年前讲学时就推崇compass了,好像是他的一个学生参与编写了该力场的程序,当时是最新的,据说也是最贵的。我是先扫描,再识别,再修正。有些公式没占上来,还有一个有机分子基团的表也没粘上来(是个图片),但大致内容都有了,

  • dongping001

    compass是力场不是模块,在使用分子力学计算时,可以选择该力场,ms里面有的

  • xiao2008zhu

    谁有杨小震的《分子模拟玉高分子材料》这本书的电子版啊~~能不能给我传一本,谢先~

猜你喜欢