对酸的承受力不同，TBS在不太浓的酸性下还能保持住，TMS见酸就掉了。而且不是用来还原的吧，主要用来做保护羟基

pH5时，用HCl调，TBS有的时候也脱掉，用磷酸不会，至于TMS，没用过不好说

TMS太不穩定了，如果用TMS保護醇的話，後面的反應都基本不用考慮用酸性條件了，TBDMS還是穩定不少的

TMS的保护对酸是很敏感的，就是你能维持pH值在5，但局部的过酸（比如在调节pH值的过程中）都可能造成其脱除。而且，TMSCl是液体，不易投料；空气敏感性高，易产生酸雾。这两个缺点使得其远不如TBDMSCl好用，后者是固体，易投料。所以，工业上常用后者。
但是，TBDMS的大位阻，使得其使用受限。因此，对于你的化合物，能否换用还得具体做了试验才知道。
从你的表述来看，你是想用便宜的TMS代替TBDMS，这个位阻变化能否影响到手性还原，还得你自己分析。通常是不影响的；除非这个待还原位点正好处于TBDMS的空间邻位，而该还原的立体选择性又需要大位阻的TBDMS来参与。
另外，你说的“间位”是什么意思，