| 查看: 10969 | 回复: 4 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
BLAST 里关于 percent identity 的问题 已有2人参与
|
|||
|
小白刚接触BLAST。请问两个微生物的蛋白质序列比对的percent identity =93%，算是这两个物种关系close吗？ 另外为何蛋白质序列比对的结果与BLASTn比对的结果percent identity不一样呢？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 生物信息学 |
» 猜你喜欢
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有205人回复
-
湖北师范大学招调剂啦
已经有7人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂
已经有6人回复
-
化工申博
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于克隆的基因能否发表的问题
已经有2人回复
- ncbi blast 上面出现了神奇的一幕！！！！
已经有2人回复
- 眼下在做关于青枯病的课题 出了问题难以解决
已经有7人回复
- 关于测序后基因分型的一些问题。。。求大神解答！
已经有2人回复
- 我亲爱的祖国——求你拯救我的Nature文章
已经有14人回复
- clustalx里面的sequence profile mode怎么使用？
已经有0人回复
- EST序列的聚类、拼接以及纠错是怎样进行的，推荐使用那些软件？！
已经有0人回复
- 关于未知菌的16s rDNA序列在ncbi上分析的结果很奇怪
已经有10人回复
- 关于T载体连接验证后测序不对
已经有3人回复
- 请教有关基因及转基因菌株方面的专利申请问题
已经有2人回复
- 关于3' RACE 测序结果分析。
已经有4人回复
- 【教程】NCBI-生物人必不可少的工具
已经有126人回复
- [RT-PCR相关] PCR相关的专业网站
已经有9人回复
- 请教大家，跨膜蛋白的同源建模，遇到了困难
已经有3人回复
- 纸上谈药，一个畅销药的奋斗史（2）
已经有14人回复
- 求教关于基因和对应蛋白的一个问题，困扰我很久，寄托万能的虫友
已经有1人回复
- 【求助/交流】关于基因序列比对
已经有6人回复
4楼2016-01-26 09:27:55
zzq4993
铜虫 (著名写手)
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 12867.9
- 散金: 88
- 红花: 7
- 帖子: 2161
- 在线: 153.1小时
- 虫号: 258728
- 注册: 2006-06-10
- 专业: 微生物学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
同问，本人对这个问题也不太了解，请大虾能够帮忙解答疑惑。 我在网上找到这么一段内容： “ 一个普遍的规律是序列决定结构，结构决定功能。研究序列相似性的目的之一是，通过相似的序列得到相似的结构或相似的功能。这种方法在大多数情况下是成功的，当然，也存在着这样的情况，即两条序列几乎没有相似之处，但分子却折叠成相同的空间形状，并具有相同的功能（很好的生物信息学教程，第三章序列比较http://www.lmbe.seu.edu.cn/cheny ... arpterThree/3.1.htm）” 这不是不就意味着，通过蛋白序列比对，来寻找具有相同催化功能的酶，理论上是可行的。虽然具有相同催化功能的酶，其蛋白一级序列不一定相似，甚至迥异。但仍然很大概率上，两个酶的氨基酸序列高度相似，则它们 会具有相同的催化功能。因此，可以通过blast比对，在氨基酸序列高度相似的蛋白中，寻找新的具有相同催化功能的酶蛋白。如此理解上述这段话，对不对。在实际操作中，这样做，是否有可行性？ |
2楼2016-01-25 16:28:28
3楼2016-01-26 01:33:48
5楼2016-01-26 14:16:48
