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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

[求助] RACE-PCR已知序列的扩增 已有2人参与

想做RACE-PCR,首先我想扩增已知序列,那么我设计引物是加酶切位点需要考虑什么呢?
普通PCR是根据想要连接的表达载体上的酶切位点来确定引物的酶切位点,这种RACE的怎么弄?跪求!!!
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yguang

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
18楼: Originally posted by yuguiyan at 2016-01-04 09:13:32
"测序完拿测出的序列去设计后面的实验"
请问后面的实验中,我用到这段序列时,用的是含有序列的质粒吗?
这个质粒是与测序载体连在一起还是需要把测序载体切掉?...

拜托下次问问题讲清楚一点,我先不管你所讲的普通PCR,race到底怎么回事,我来告诉你怎么做吧,race是要扩增未知的序列,但此未知序列的一端相邻的序列知道一部分,就拿这部分已知序列设计一段引物,与race引物一起进行扩增,扩增出的序列或者连载体(当然T载体最方便)去测序或者不连载体直接测序(需提供引物给测序公司,但race引物量应该不够,也太浪费,不建议此法),测序后就知道扩增出的片段序列了,然后根据测出的序列设计引物进行后续实验,根据序列内部酶切位点和后续工作中用到的载体上的酶切位点(做后续工作中可能把片段要从一个载体切下来连到另一载体上,如果这样,要考虑所有要用到载体上的合适位点)确定要用到酶切位点,把酶切位点加到所设计引物上,再加上保护碱基,合成引物进行PCR得到此前未知目的片段。
24楼2016-01-06 09:25:11
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曼陀罗的祈祷

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
亲,你还没搞明白,是你先做RACE得到全部的序列,加酶切位点的话是需要专门设计引物的,而这两个是没有关联的,RACE引物和酶切位点的引物不一样,扩出来的产物也不一样,之后的用途也不一样,完全是两个方向
想做个有趣的人,却在逗比的道路上越走越远~
22楼2016-01-05 09:48:40
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yguang

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
race为什么要加酶切位点?先race出来产物进行测序,用测出的精确序列再设计引物加酶切位点进行后续工作,否则序列里是否有你加的酶切位点都不知道做,往下可能会出很多问题
6楼2016-01-03 00:14:54
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yguang

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

做race就是为了得到序列测序,测序完拿测出的序列去设计后面的实验,测序载体只是为了方便用通用引物测序,跟你后续实验无关,你可以连在任意载体去测序,也可以直接拿race出的产物去测序
17楼2016-01-04 01:57:03
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普通回帖

yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

2楼2016-01-02 18:22:17
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

3楼2016-01-02 18:30:04
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

4楼2016-01-02 19:55:15
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

5楼2016-01-02 22:55:47
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yguang at 2016-01-03 00:14:54
race为什么要加酶切位点?先race出来产物进行测序,用测出的精确序列再设计引物加酶切位点进行后续工作,否则序列里是否有你加的酶切位点都不知道做,往下可能会出很多问题

我先利用普通PCR将已知的一段序列扩增出来,此时我想测序,连接T载体,那么测完序,想要做RACE时,需要把T载体切下来吗?
7楼2016-01-03 11:15:28
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匿名

用户注销 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖仅楼主可见
8楼2016-01-03 11:32:19
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 大-木-虫 at 2016-01-03 11:32:19
刚开始最好不要加酶切位点,做RACE无非是想知道序列,先得到你的序列再说。

我先利用普通PCR将已知的一段序列扩增出来,此时我想测序,连接T载体,

那么测完序,想要做RACE时,需要把T载体切下来吗?
9楼2016-01-03 11:35:03
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

10楼2016-01-03 14:58:29
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