24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1458  |  回复: 6

tarmountain

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助,gromacs在加溶剂时无法生成top文件。 已有3人参与

我打的指令是genbox,指令中的gro文件正常输出了,但是无法输出top文件,有大神告诉我这是为什么吗?

发自小木虫IOS客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
生成top用pdb2gmx命令
gromacs
2楼2015-11-08 13:41:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

awaken2013

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
top文件会自动覆盖的
你先拉到top文件最下面 看看有没有top system里面有没有加入的水。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2015-11-09 01:58:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tarmountain

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by awaken2013 at 2015-11-09 01:58:53
top文件会自动覆盖的
你先拉到top文件最下面 看看有没有top system里面有没有加入的水。

谢谢,我是个小白,这个软件好难学啊?你是怎么弄明白这些的?

发自小木虫IOS客户端
4楼2015-11-09 23:29:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

花开满天

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
top文件在后期都是自己编写的,前面如果是试下例子的话可以按楼上的命令

发自小木虫IOS客户端
5楼2015-11-09 23:31:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

awaken2013

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by tarmountain at 2015-11-09 23:29:24
谢谢,我是个小白,这个软件好难学啊?你是怎么弄明白这些的?
...

看看手册 做几遍就会了

发自小木虫IOS客户端
6楼2015-11-10 01:14:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
7楼2015-11-10 07:37:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 tarmountain 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 309求调剂 +17 谁不是少年 2026-03-29 17/850 2026-03-31 19:50 by mg1014
[考研] 材料科学与工程339求调剂 +3 hyz0119 2026-03-31 3/150 2026-03-31 18:31 by 1939136013狗壮
[考研] 311求调剂一志愿合肥工业大学 +11 秋二十二 2026-03-30 11/550 2026-03-31 18:09 by 253863592
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +18 荷包蛋hyj 2026-03-26 18/900 2026-03-31 18:08 by 544594351
[考研] 274求调剂 +6 xiao爱同学 2026-03-30 6/300 2026-03-31 10:04 by cal0306
[考研] 一志愿食品科学与工程083200求调剂 +4 XQTJZ 2026-03-30 4/200 2026-03-31 04:10 by fmesaito
[考研] 调剂 +4 GK72 2026-03-30 4/200 2026-03-30 20:32 by dick_runner
[考研] 327求调剂 +5 小卡不卡. 2026-03-29 5/250 2026-03-30 19:30 by Wang200018
[考研] 0703化学321分求调剂 +10 三dd. 2026-03-30 11/550 2026-03-30 19:24 by markhwc
[考研] 抱歉 +3 田洪有 2026-03-30 3/150 2026-03-30 19:11 by 迷糊CCPs
[考研] 328求调剂 +8 嗯滴的基本都 2026-03-27 8/400 2026-03-30 17:20 by Wang200018
[考研] 305求调剂 +8 RuiFairyrui 2026-03-28 8/400 2026-03-29 08:22 by fmesaito
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +6 崔wj 2026-03-26 6/300 2026-03-29 01:11 by hanserlol
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +7 小小甜面团 2026-03-25 7/350 2026-03-28 20:25 by 唐沐儿
[考研] 复试调剂 +3 raojunqi0129 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:27 by 落睿可思
[考研] 一志愿厦门大学化学学硕307求调剂 +10 y7czhao 2026-03-26 10/500 2026-03-28 14:23 by 唐沐儿
[考研] 复试调剂,一志愿南农083200食品科学与工程 +5 XQTJZ 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:49 by 狂炫麦当当
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
[考研] 一志愿天津大学339材料与化工求调剂 +3 江往卖鱼 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:42 by 王小欠i
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-25 3/150 2026-03-25 19:03 by Ainin_
信息提示
请填处理意见