| 查看: 967 | 回复: 3 | |||
xiao_2008金虫 (正式写手)
|
[交流]
【求助】求助详细安装gromacs的步骤，谢谢 已有3人参与
|
| 本人是新手，下载了linux下的版本，但是安装了好久都没有安装上，求助有没有详细点的安装步骤啊 谢谢 |
回复此楼» 猜你喜欢
纯娱乐，不喜欢勿喷
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有6人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有7人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有8人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有8人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有11人回复
-
娱乐
已经有4人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教GROMACS安装
已经有8人回复
- [新手求教]安装Gromacs后，查看pdb2gmx命令，显示无此命令
已经有9人回复
- 【求助】如何使用gromacs中的constraint
已经有8人回复
- 【求助】怎样才能使整个盒子充满水,用gromacs
已经有6人回复
- 【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢
已经有11人回复
- 【求助】GROMACS分析二面角随时间的变化
已经有4人回复
- 【求助】gromacs出现了一个问题
已经有10人回复
- 【求助】求一个gromacs的中文教程，包括安装的部分，小弟新手，从零学起
已经有8人回复
- 【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多吗？如何选择？
已经有7人回复
- 【求助】NAMD和Gromacs哪个简单？
已经有5人回复
- 【求助】求GROMACS模拟表面活性剂在油水表面的行为的例子
已经有7人回复
2楼2010-12-12 17:39:04
3楼2010-12-12 20:33:28
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+10):谢谢 2010-12-14 17:10:31
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+10):谢谢 2010-12-14 17:10:31
|
gromacs安装流程 (1) 解压缩fftw，lam-mpi，gromacs源码 tar -zxvf fftw-3.1.2.tar.gz tar –zxvf gromacs-3.3.1.tar.gz tar -zxvf lam-7.1.3.tar.gz (2) 编译lam-mpi cd lam-7.1.3 ./configure --prefix=/home/lam-7.1.3 --without-fc --with-rsh="ssh-x" make make install 注：--without-fc是不编译mpif77，可以去掉 (3) 添加mpi环境变量 export PATH=$PATH:/home/lam-7.1.3/bin ( append to .bashrc) (4) 编译fftw单双精度版 cd fftw-3.1.2 ./configure --enable-float --enable-mpi --prefix=/home/fftw-3.1.2 make make install make distclean ./configure --disable-float --enable-mpi --prefix=/home/fftw-3.1.2 (3) 设置fftw环境变量 export CPPFLAGS=-I/home/fftw-3.1.2/include export LDFLAGS=-L/home/fftw-3.1.2/lib (4) 编译gromacs cd gromacs-3.3.1 ./configure --prefix=/home/gromacs-3.3.1 --enable-mpi make make install make distclean ./configure --prefix=/home/gromacs-3.3.1 --program-suffix=_d --enable-mpi --disable-float (5) 设置gromacs环境变量 export PATH=$PATH:/home/gromacs-3.3.1/bin ( append to .bashrc) (6) 编译gromacs源包里的其它文件（可选） make contrib |
4楼2010-12-14 03:41:22
50