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xiao_2008金虫 (正式写手)
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【求助】求助详细安装gromacs的步骤，谢谢 已有3人参与
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| 本人是新手，下载了linux下的版本，但是安装了好久都没有安装上，求助有没有详细点的安装步骤啊 谢谢 |
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2楼2010-12-12 17:39:04
3楼2010-12-12 20:33:28
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+10):谢谢 2010-12-14 17:10:31
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ghcacj(金币+10):谢谢 2010-12-14 17:10:31
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gromacs安装流程 (1) 解压缩fftw，lam-mpi，gromacs源码 tar -zxvf fftw-3.1.2.tar.gz tar –zxvf gromacs-3.3.1.tar.gz tar -zxvf lam-7.1.3.tar.gz (2) 编译lam-mpi cd lam-7.1.3 ./configure --prefix=/home/lam-7.1.3 --without-fc --with-rsh="ssh-x" make make install 注：--without-fc是不编译mpif77，可以去掉 (3) 添加mpi环境变量 export PATH=$PATH:/home/lam-7.1.3/bin ( append to .bashrc) (4) 编译fftw单双精度版 cd fftw-3.1.2 ./configure --enable-float --enable-mpi --prefix=/home/fftw-3.1.2 make make install make distclean ./configure --disable-float --enable-mpi --prefix=/home/fftw-3.1.2 (3) 设置fftw环境变量 export CPPFLAGS=-I/home/fftw-3.1.2/include export LDFLAGS=-L/home/fftw-3.1.2/lib (4) 编译gromacs cd gromacs-3.3.1 ./configure --prefix=/home/gromacs-3.3.1 --enable-mpi make make install make distclean ./configure --prefix=/home/gromacs-3.3.1 --program-suffix=_d --enable-mpi --disable-float (5) 设置gromacs环境变量 export PATH=$PATH:/home/gromacs-3.3.1/bin ( append to .bashrc) (6) 编译gromacs源包里的其它文件（可选） make contrib |
4楼2010-12-14 03:41:22
