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liuliqujing

新虫 (初入文坛)

[求助] 长片段PCR扩增 已有2人参与

大家好,想请教下:我做全长克隆,分两段分别设计引物扩增目的片段,先反转为cDNA,再PCR。我的片段一段为4324bp,一段为2100bp,但是4324bp的一直扩增不出来,引物二聚体挺亮。2100bp扩增出来了,但特异性不好。我用的takara的PrimeScript II 1st Strand cDNA合成试剂盒合成cDNA,PCR用PrimeSTAR Max DNA Polymerase和LA Taq with GC Buffer 分别扩增过,长片段一直也扩增不出来,我的PCR程序:98℃ 2min,(98℃ 10s, 60℃ 15s, 72℃ 5min)*35, 72℃ 5min。中途解链时间,退火温度时间均延长过,一直没结果。引物是没有问题的,已检查比对过。谢谢。
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足下客

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

大片段就是不好扩,很头疼。能不能像楼上似的,做个温度梯度试试,或者是换引物看看。有没有别的牌子的LA酶?
4楼2015-11-02 08:45:28
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凯伦爱佳佳

金虫 (正式写手)

我也是啊,我的全长2000多,我做温度梯度扩出来一次。但是之后就再也扩不出来了。
2楼2015-11-01 21:48:52
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zhangyao7255

新虫 (小有名气)

你可以试试不同的反转录方式,只能提示到这里了。。。

发自小木虫Android客户端
3楼2015-11-01 23:22:42
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上官寒武

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

为什么不放一起扩啊  6K很容易就扩出来了啊 特别是外显子区域设计引物  产物率很高的啊
5楼2015-11-03 09:33:34
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