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sun183635

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何知道配体小分子的结构序列 已有1人参与

SA-华法令复合物晶体结构来自Brookhaven蛋白质数据库(蛋白质编码: 1h9z),除去配体华法令、脂肪酸和水分子。
怎么除去这些配体小分子啊,根本不知道他们的PDB序列啊,也不知道他们的结构。新手求教
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屁桃粉

新虫 (小有名气)

3楼2015-10-23 16:48:09
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a86052

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sun183635: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-10-23 19:34:22
用文本编辑器-写字板打开PDB文件,配体和水分子中原子一般都是HETATM,蛋白原子是ATOM,把HETATM那些行都删掉,就可以了
2楼2015-10-23 16:06:26
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sun183635

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by a86052 at 2015-10-23 16:06:26
用文本编辑器-写字板打开PDB文件,配体和水分子中原子一般都是HETATM,蛋白原子是ATOM,把HETATM那些行都删掉,就可以了

那那个脂肪酸应该怎么处理呢,刚接触啥都不懂
4楼2015-10-23 19:33:25
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