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zhouzhiguang

金虫 (小有名气)

[求助] 配体的已知基团和蛋白质受体中的已知位点(锌离子)如何手动对接?实金求助

各位大侠们,小弟现在课题思路都已经定了,但是有一个瓶颈突破不了,求助:
    目前有一个配体化合物的固定基团要和蛋白质受体中的已知位点(该位点为金属离子)通过手动对接的方法将他们以共价键的形式连接起来,作为下一步的准备结构。(ds或者gold都可以的,最好用gold),一定要是两个指定的作用位点(配体化合物小分子的指定基团和蛋白质受体的指定位点(金属离子))
如下图(PDB文件中的抑制剂配体和蛋白质中Zn离子的作用模式图)所示:

也就是抑制剂换过了,但是我知道抑制剂的作用位点,要和蛋白质中的金属zn离子相互作用,进行手动对接即可。
     为了感谢提供详细方法和操作步骤的同学,当然这个方法是需要通过我自己操作后确认的,我愿意通过支付宝向其支付20元现金(10元DS,10元gold),因为知识就是财富。谢谢大家了。感激涕零。

抑制剂和蛋白质中zn的作用模式.jpg
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