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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » NCBI中的基因图谱
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liwan901020

新虫 (初入文坛)

[求助] NCBI中的基因图谱已有2人参与

NCBI的Nucleotide下的 Graphics中的箭头只要是向左的就标注Location: complement ，依据是什么呢？互补链不是相对的吗？
如链接：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... &to=1600867求大神指点
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1楼2015-07-05 20:28:57
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liwan901020: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-07-06 18:38:47
基因组测序后，会人为的把拼接好的其中一条链作为测序结果，而另一条链则称为互补链。这里互补指的是该基因的编码链在基因组两条链的互补连上，没有标注互补意思就是该基因的编码链即为当前链。
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4楼2015-07-06 17:11:54
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ppppppppp

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
DNA有两条链，其中一条是编码链。genbank中只是一条链，不一定他就是编码链，也有可能是他的互补链。比方说上面那条5‘-3’方向是向右，互补链就是向左了。不知道懂了没有。
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初来乍到，请多指教
2楼2015-07-05 21:09:17
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liwan901020

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ppppppppp at 2015-07-05 21:09:17
DNA有两条链，其中一条是编码链。genbank中只是一条链，不一定他就是编码链，也有可能是他的互补链。比方说上面那条5‘-3’方向是向右，互补链就是向左了。不知道懂了没有。

感谢您的回复！
请看截图里面，我不明白的是箭头方向有左有右，为什么向左的就标为互补呢？为什么向右的不是互补呢？而且所有的菌都是这样。
DNA的两条链都可以是编码链吧，好像正义链、反义链不是绝对的，跟基因在哪条链上有关。
NCBI中的基因图谱
QQ截图20150706155302.png
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3楼2015-07-06 15:56:13
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ppppppppp

新虫 (小有名气)
一条链是正义链，那么只有它才能转录翻译，dna上的启动子序列只能启动一条链的转录，rna上的rbs位点等也是翻译必须的。相反，互补链就不能转录翻译了。另外，如果互补链上有启动子，那么互补链就是正义链，但是测序时候是测的正链，这时候就需要加complement

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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初来乍到，请多指教
5楼2015-07-08 01:32:50
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