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liwan901020

新虫 (初入文坛)

[求助] NCBI中的基因图谱已有2人参与

NCBI的Nucleotide下的 Graphics中的箭头只要是向左的就标注Location: complement ,依据是什么呢?互补链不是相对的吗?
如链接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... &to=1600867求大神指点
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ppppppppp

新虫 (小有名气)

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DNA有两条链,其中一条是编码链。genbank中只是一条链,不一定他就是编码链,也有可能是他的互补链。比方说上面那条5‘-3’方向是向右,互补链就是向左了。不知道懂了没有。
初来乍到,请多指教
2楼2015-07-05 21:09:17
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liwan901020

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ppppppppp at 2015-07-05 21:09:17
DNA有两条链,其中一条是编码链。genbank中只是一条链,不一定他就是编码链,也有可能是他的互补链。比方说上面那条5‘-3’方向是向右,互补链就是向左了。不知道懂了没有。

感谢您的回复!
请看截图里面,我不明白的是箭头方向有左有右,为什么向左的就标为互补呢?为什么向右的不是互补呢?而且所有的菌都是这样。
DNA的两条链都可以是编码链吧,好像正义链、反义链不是绝对的,跟基因在哪条链上有关。
NCBI中的基因图谱
QQ截图20150706155302.png

3楼2015-07-06 15:56:13
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

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liwan901020: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-07-06 18:38:47
基因组测序后,会人为的把拼接好的其中一条链作为测序结果,而另一条链则称为互补链。这里互补指的是该基因的编码链在基因组两条链的互补连上,没有标注互补意思就是该基因的编码链即为当前链。
4楼2015-07-06 17:11:54
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ppppppppp

新虫 (小有名气)

一条链是正义链,那么只有它才能转录翻译,dna上的启动子序列只能启动一条链的转录,rna上的rbs位点等也是翻译必须的。相反,互补链就不能转录翻译了。另外,如果互补链上有启动子,那么互补链就是正义链,但是测序时候是测的正链,这时候就需要加complement

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
初来乍到,请多指教
5楼2015-07-08 01:32:50
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