| 查看: 5291 | 回复: 15 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
solarman新虫 (正式写手)
|
[求助]
vasp成功安装后运行时出现Segmentation fault (signal 11)错误，求指教 已有3人参与
|
||
|
vasp并行安装成功，cpu是xeon 2630v3×2，64G内存，机器上同时安装了mpich2和openmpi，但which mpif90后显示：/opt/software/mpich2-intel/bin/mpif90 同样，which mpirun后显示：/opt/software/mpich2-intel/bin/mpirun 表明实际使用的mpi是mpich2的。 同时还安装了fftw库。 运行了数个vasp作业，均出现以下信息： ===================================================================================== = BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES = EXIT CODE: 11 = CLEANING UP REMAINING PROCESSES = YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES ===================================================================================== APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Segmentation fault (signal 11) 将makefile的设置贴出来，请大家帮忙看看，究竟是哪里出了问题？多谢了！ SUFFIX=.f90 FC=mpif90 FCL=$(FC) CPP_ = ./preprocess <$*.F | /usr/bin/cpp -P -C -traditional >$*$(SUFFIX) CPP = $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \ -DCACHE_SIZE=12000 -DPGF90 -Davoidalloc -DNGZhalf \ -DMPI_BLOCK=8000 -Duse_collectiveK FFLAGS = -FR -names lowercase -assume byterecl OFLAG=-O2 -ip OFLAG_HIGH = $(OFLAG) OBJ_HIGH = OBJ_NOOPT = DEBUG = -FR -O0 INLINE = $(OFLAG) MKLROOT=/opt/intel/icc/composer_xe_2013.3.163/mkl MKL_PATH=$(MKLROOT)/lib/intel64 IFC_LIB_PATH=/opt/intel/icc/composer_xe_2013.3.163/compiler/lib/intel64 BLAS=-L$(MKL_PATH) -lmkl_intel_lp64 -lmkl_blacs_lp64 -lmkl_intel_thread -lmkl_core -liomp5 -lpthread -lmkl_lapack95_lp64 LAPACK= $(MKL_PATH)/libmkl_intel_lp64.a LIB = -L../vasp.5.lib -ldmy \ ../vasp.5.lib/linpack_double.o $(LAPACK) \ $(BLAS) LINK = FFT3D = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o /opt/mathlib/fftw-3.3.3/lib/libfftw3.a INCS = -I/opt/intel/icc/composer_xe_2013.3.163/mkl/include/fftw |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 VASP |
» 猜你喜欢
复试调剂
已经有11人回复
-
311求调剂
已经有13人回复
-
22408调剂求助
已经有9人回复
-
085410 273求调剂
已经有3人回复
-
材料考研调剂
已经有9人回复
-
085600材料与化工329分求调剂
已经有12人回复
-
0854调剂
已经有4人回复
-
调剂求收留
已经有14人回复
-
0831生医工第一轮调剂失败求助
已经有10人回复
-
一志愿东北大学控制工程085406数二英二385，求调剂
已经有8人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- VASP5.2串行安装出现的问题
已经有10人回复
- 安装时提示有错误，装上后不能完整运行
已经有5人回复
- VASP计算时，TOTAL-FORCE这么高是什么原因，求大神
已经有8人回复
- 使用music_code运行出现错误
已经有4人回复
- Error: segmentation violation
已经有5人回复
- VASP5.3并行安装时报错，求大神指点
已经有19人回复
- vasp串行，并行编译成功，但很奇怪。
已经有23人回复
- vasp5.3安装问题求助
已经有8人回复
- vasp结构优化出现问题：算完一个离子步后就停止
已经有12人回复
- ssh上运行程序出现segmentation fault
已经有6人回复
- 求助vasp编译好后无法运行问题？？
已经有24人回复
- ＶＡＳＰ计算出错，请高手指点
已经有19人回复
- vasp 并行运算出错
已经有7人回复
- vasp优化结构中出现的问题
已经有10人回复
- 【求助】Segmentation fault
已经有15人回复
- 【求助】vasp并行安装mpich2的错误
已经有10人回复
- 【求助】vasp计算的结果显示segmentation fault是什么错误
已经有5人回复
- 【求助】dl_poly segmentation fault
已经有6人回复
- 【求助】什么是Segmentation fault?
已经有11人回复
- 【求助】vasp5.2异常退出的问题
已经有16人回复
wmy8802217
木虫 (正式写手)
- 应助: 89 (初中生)
- 金币: 2877
- 红花: 12
- 帖子: 350
- 在线: 461.9小时
- 虫号: 2935682
- 注册: 2014-01-16
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
4楼2015-06-20 13:21:34
wmy8802217
木虫 (正式写手)
- 应助: 89 (初中生)
- 金币: 2877
- 红花: 12
- 帖子: 350
- 在线: 461.9小时
- 虫号: 2935682
- 注册: 2014-01-16
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2015-06-20 11:15:45
solarman
新虫 (正式写手)
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 1210.9
- 散金: 492
- 红花: 2
- 帖子: 458
- 在线: 210.5小时
- 虫号: 599917
- 注册: 2008-09-11
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
|
运行ulimit -a unlimited后，显示 core file size (blocks, -c) 0 data seg size (kbytes, -d) unlimited scheduling priority (-e) 0 file size (blocks, -f) unlimited pending signals (-i) 257702 max locked memory (kbytes, -l) 64 max memory size (kbytes, -m) unlimited open files (-n) 1024 pipe size (512 bytes, -p) 8 POSIX message queues (bytes, -q) 819200 real-time priority (-r) 0 stack size (kbytes, -s) unlimited cpu time (seconds, -t) unlimited max user processes (-u) 1024 virtual memory (kbytes, -v) unlimited file locks (-x) unlimited 可以看到cpu时间和运行内存都是不受限的，是否存在其他原因？ |
3楼2015-06-20 12:38:49
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3522.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
5楼2015-06-20 14:27:27
