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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp优化结构中出现的问题
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泰山童子

铜虫 (小有名气)

[求助] vasp优化结构中出现的问题

VERY BAD NEWS! internal error in subroutine SGRCON:
Found some non-integer element in rotation matrix
看到官网上说把对称性取消，可问题又来了。。
ZBRENT: fatal internal in bracting
                system-shut down; contact gK immediately结果已经收敛了，官网上说的含糊不清是不是收敛了就可以了啊，另外这种warning如何避免，求高手指条明路啊
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1楼2011-07-26 08:59:06
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bingmou

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
贺仪(金币+1): 多谢交流 2011-07-26 09:16:39
泰山童子(金币+10): 2011-07-26 13:34:13
把你的POSCAR和INCAR放上来看看，应该是POSCAR有问题
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2楼2011-07-26 09:04:28
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泰山童子

铜虫 (小有名气)
原子坐标太多了应该不是poscar 的事，我用ms导出的坐标，而且同样的我用LDA势库可以算，但用PAW不管PE还是91都出现我上面的问题，我用的是一次性优化，就是把contar cp为poscar后那一步出现的这个问题。
my incar
SYSTEM=ABCD
ENCUT=350
ISTART=0;ICHARG=2
ISMEAR=1
ISIF=4
IBRION=2
NSW=200
EDIFF=-1E-5
EDIFFG=-1E-3
GGA=91
VOSKOWN=1
PREC=Accurate
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3楼2011-07-26 10:17:53
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泰山童子

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-07-26 09:04:28:
把你的POSCAR和INCAR放上来看看，应该是POSCAR有问题

原子坐标太多了应该不是poscar 的事，我用ms导出的坐标，而且同样的我用LDA势库可以算，但用PAW不管PE还是91都出现我上面的问题，我用的是一次性优化，就是把contar cp为poscar后那一步出现的这个问题。
my incar
SYSTEM=ABCD
ENCUT=350
ISTART=0;ICHARG=2
ISMEAR=1
ISIF=4
IBRION=2
NSW=200
EDIFF=-1E-5
EDIFFG=-1E-3
GGA=91
VOSKOWN=1
PREC=Accurate
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4楼2011-07-26 10:18:26
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泰山童子

铜虫 (小有名气)
有木有好心人啊
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5楼2011-07-27 11:03:10
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gougou531

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
6楼2011-07-30 11:28:09
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hn19870519

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-07-30 16:27:25
泰山童子(金币+20): 问题以解决了~自己的问题，多谢~ 2011-08-15 13:07:19
我也遇到过这个问题。。。试试用算完的CONTCAR再跑一遍。
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7楼2011-07-30 15:19:35
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gaojunfeng83

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
mazuju028(金币+2): 谢谢交流 2011-07-31 22:29:13
泰山童子(金币+20): 谢谢~问题已解决，又学到不少哈哈~ 2011-08-15 13:06:58
EDIFFG 正的代表能量 负值代表力，我记得vasp手册还是教程上说，一个结构要多次优化，直到输入结构和输出结构基本变化，才能确定收敛，这里指的应该是EDIFFG用的正值，因为用负值，一次优化就够了，再优化，结构也不会变。但vasp上又说用负值是更有效的手段。所以很迷糊。
出现这个问题，一般是结构已经收敛了，vasp找不到下一步能量下降的梯度，应该可以直接用这个结构了，如果不放心，可以重复contcar copy poscar ，再优化，cp几次后，就会 reached required accuracy。
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8楼2011-07-31 11:07:26
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bingmou

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
mazuju028(金币+2): 谢谢交流 2011-07-31 22:29:54
泰山童子(金币+20): 谢谢~原因已找到了，仔细检查了下确实是poscar出问题了，自己粗心造成的。。。 2011-08-15 13:05:38
引用回帖:
8楼: Originally posted by gaojunfeng83 at 2011-07-31 11:07:26:
EDIFFG 正的代表能量 负值代表力，我记得vasp手册还是教程上说，一个结构要多次优化，直到输入结构和输出结构基本变化，才能确定收敛，这里指的应该是EDIFFG用的正值，因为用负值，一次优化就够了，再优化，结构也 ...

之所以说负值毕竟准确是因为正值只是要求整个体系的总能量达到熟练，而负值则要求对每个原子上面的力达到收敛，显然后者优于前者
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9楼2011-07-31 11:46:10
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shelay

木虫 (正式写手)
引用回帖:
756372楼: Originally posted by gougou531 at 2011-07-30 11:28:09
泰山童子，我也遇到了同样的问题啊，就是出现你上面说的fatal internal in brackting
system-shutdown；contack gk immediately
但是在上面一步已经出现这样的字样：accuracy reached，这是什么情况，同问啊。还 ...

力的收敛参数（EDIFFG）太高了吧，可能-0.01就够了，这样可能能解决问题
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10楼2012-08-23 20:17:57
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