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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp结构优化出现问题：算完一个离子步后就停止
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wangjb401

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1楼 2013-07-02 15:34:28
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emilyoyang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by wangjb401 at 2013-07-03 10:26:42
非常感谢您的悉心回复，我加入FFLAGS= -heap-arrays 64出现无法编译的情况，
报错如下图所示，是不是我的makefile里应该这么写呢？
FFLAGS =  -FR -lowercase -assume byterecl -heap-arrays 64
# FFLAGS = -I/ ...

不用分行写，直接FFLAGS =  -I/opt/intel/mkl/10.2.2.025/include/fftw -FR -lowercase -assume byterecl -heap-arrays 64
错误原因应该是 fftw3.f文件没有找到   在你的服务器上找到fftw3.f 文件（命令：locate fftw3.f）
把它copy到vasp编译目录下，前面设置的fftw include路径程序并没有自动寻找到
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wangjb401
12楼2013-07-03 14:12:36
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wangjb401

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2楼2013-07-02 16:11:39
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hn19870519

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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wangjb401: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-07-02 22:29:56
看第一条提示：forrtl: Disk quota exceeded
貌似是管理员分给每个用户的空间满了。你试试删掉一些个人目录下的东西再算。
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wangjb401
3楼2013-07-02 16:15:41
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wangjb401

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4楼2013-07-02 16:20:24
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wangjb401

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5楼2013-07-02 16:47:54
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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wangjb401: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-07-02 22:29:49
引用回帖:
5楼: Originally posted by wangjb401 at 2013-07-02 16:47:54
我删了部分目录重新计算，也出现了类似问题，请问还有没有其他可能呢，有没有命令可以查使用空间呢？...

查看磁盘空间 du -sh ，     在你的账号下输入这个命令 du  -sh * 显示所有目录所占磁盘空间   
天河1号有时候会出现I/O 读写错误 ，但你这个LS已经说了 磁盘空间不足，无法写入
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wangjb401
6楼2013-07-02 19:05:20
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wangjb401

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7楼2013-07-02 22:29:39
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wangjb401

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8楼2013-07-02 22:43:55
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emilyoyang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wangjb401 at 2013-07-02 22:43:55
再麻烦您一下，我在曙光上提任务，在保证输入文件无误（在天河上可运行）的情况下，经常出现一提任务就掉，或者一个离子步后掉，out文件显示：
running on   80 nodes
distr:  one band on    1 nodes,   80 g ...

这个问题跟磁盘空间没关系
错误信息：node1 exited on signal 11 (Segmentation fault)
你参看一下这个帖子
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3574542
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wangjb401
9楼2013-07-02 23:57:04
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wangjb401

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10楼2013-07-03 10:26:42
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