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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】ＶＡＳＰ如何计算　离子　
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13611936804

金虫 (小有名气)

飞得更高！驰骋翱翔！

[交流] 【求助】ＶＡＳＰ如何计算　离子　已有4人参与

如何在MS中建模，用VASP进行 离子 的 计算 ？　例如　Ｈ＋　　
如何在ＭＳ中画出一个Ｈ＋离子　，并投入ＶＡＳＰ中进行优化　？　
优化　氢气　。氢原子　我会的　　，但是　Ｈ＋该如何下手　？　
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知足常乐~
1楼2010-03-31 20:54:37
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alick1102

铜虫 (小有名气)
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gavinliu7390(金币+1):谢谢！ 2010-04-01 14:56
你可以在INCAR里通过NELECT来设置电子数目。比如OH默认是7个电子，OH-你就设成8就可以了。
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到了博士的时候才知道，科学也不过是为了吃饭的。
4楼2010-04-01 12:54:41
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alick1102

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
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gavinliu7390(金币+2):谢谢参与！ 2010-04-01 11:06
引用回帖:
Originally posted by 13611936804 at 2010-03-31 20:54:37:
如何在MS中建模，用VASP进行 离子 的 计算 ？　例如　Ｈ＋　　
如何在ＭＳ中画出一个Ｈ＋离子　，并投入ＶＡＳＰ中进行优化　？　
优化　氢气　。氢原子　我会的　　，但是　Ｈ＋该如何下手　？　

VASP里面得到的E是与电子相关的能量，H+没有电子，所以就没有轨道能，就谈不上得到能量了。

你可以认为H+ 的能量是零。
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到了博士的时候才知道，科学也不过是为了吃饭的。
2楼2010-04-01 00:16:23
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13611936804

金虫 (小有名气)

飞得更高！驰骋翱翔！
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Originally posted by alick1102 at 2010-04-01 00:16:23:



VASP里面得到的E是与电子相关的能量，H+没有电子，所以就没有轨道能，就谈不上得到能量了。

你可以认为H+ 的能量是零。

那要是我要计算 氢氧根 呢？　我的意思是说，怎样在ＭＳ里面表现出　　氢氧根　与　　羟基　　的区别　？两者都是有一个氢原子与一个氧原子结合形成的，但是　氢氧根多一个电子，我怎么能表现出来氢氧根比羟基多一个电子呢？　再就是进行ＶＡＳＰ计算的时候　　氢氧根　与　羟基肯定是不一样的性质吧　　，我该如何进行设置　来区别两者　　

望不吝赐教～
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知足常乐~
3楼2010-04-01 10:40:36
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nbaliver

木虫 (初入文坛)
★ ★
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qli0218(金币+1):谢谢 2010-04-01 20:54
引用回帖:
Originally posted by 13611936804 at 2010-04-01 10:40:36:


那要是我要计算 氢氧根 呢？　我的意思是说，怎样在ＭＳ里面表现出　　氢氧根　与　　羟基　　的区别　？两者都是有一个氢原子与一个氧原子结合形成的，但是　氢氧根多一个电子，我怎么能表现出来氢氧根比羟基 ...

应该在里面加一个补偿电荷吧 VASP是周期性系统 如果你的系统不是中性 那表观的电荷就是正无穷或者负无穷大了 所以应该对氢氧根离子加一个正电荷补偿 不妨把你前面的 H+ 加入你的unit cell 里
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5楼2010-04-01 16:49:16
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13611936804

金虫 (小有名气)

飞得更高！驰骋翱翔！
引用回帖:
Originally posted by alick1102 at 2010-04-01 12:54:41:
你可以在INCAR里通过NELECT来设置电子数目。比如OH默认是7个电子，OH-你就设成8就可以了。

那样的话   如果是 氢氧根吸附催化剂表面的体系，程序能把这一个电子准确的加到氢氧根上吗 ？    而不是整个体系多一个电子  ？
还有，如果体系中 同时含有 正负离子  ，而总电荷是0，那该怎么办呢 ？ NELECT 怎么设置呢  ？
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知足常乐~
6楼2010-04-02 10:38:26
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stractor

金虫 (著名写手)
★
gavinliu7390(金币+1):谢谢！ 2010-04-03 17:34
引用回帖:
Originally posted by 13611936804 at 2010-04-02 10:38:26:

那样的话   如果是 氢氧根吸附催化剂表面的体系，程序能把这一个电子准确的加到氢氧根上吗 ？    而不是整个体系多一个电子  ？
还有，如果体系中 同时含有 正负离子  ，而总电荷是0，那该怎么办呢 ？ NELECT ...

电子自洽自后，这个电子就在氢氧根上。
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7楼2010-04-03 17:22:15
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13611936804

金虫 (小有名气)

飞得更高！驰骋翱翔！
引用回帖:
Originally posted by stractor at 2010-04-03 17:22:15:

电子自洽自后，这个电子就在氢氧根上。

那你的意思就是说只要在NELECTOR设置好电子数，程序会自动把电荷加到相应的基团上去的 ？
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知足常乐~
8楼2010-04-06 21:43:27
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stractor

金虫 (著名写手)
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qli0218(金币+1):谢谢 2010-04-07 21:04
13611936804(金币+2):实践出真知！ 2010-04-08 10:23
引用回帖:
Originally posted by 13611936804 at 2010-04-06 21:43:27:

那你的意思就是说只要在NELECTOR设置好电子数，程序会自动把电荷加到相应的基团上去的 ？

我曾经做个带电缺陷，电荷自洽后，做了一个电荷密度分布图，确实发现这个多余或减少的电荷九子缺陷原子处，而且老外也是这么认为的。所以就是NELECT关键字。
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9楼2010-04-07 16:02:48
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lidaoyong

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ms-soft:    如果我要吸附一个离子，如ca+的话，是不是先修改ca原子属性里面的charge为1，然后再修改计算对话框中的charge（体系的电荷）为1呢？
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2584737&pid=2139022&page=2#pid2139022
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FDTD+Comsol软件学习应用中，期待与大家的交流
10楼2010-11-16 18:25:44
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