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nkleof银虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】vasp的计算时间含义
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优化一个结构，发现每个离子步的计算有两个计算时间数据，一个是cpu time，一个是real time，而且两个数据有时候差别较大。 我的理解是cpu time是vasp100%利用cpu运算的时间，real time是整个作业所耗的时间，包含数据读取写入或者并行节点间的等待时间等等。cpu time和real time的比值表示并行计算效率。 那么从下面的优化时间数据来看，对于同一个体系结构，进行优化的中间各步的计算效率差别会比较大，这是为什么？各步的内存占用应该是差不多的啊，为什么有的效率高，有的效率低？影响计算效率的关键因素是什么呢？ LOOP+: cpu time31435.63: real time49241.05 LOOP+: cpu time17906.79: real time18247.08 LOOP+: cpu time17024.20: real time27126.50 ~~~~~~ ~~~~~~ LOOP+: cpu time15354.10: real time18461.83 LOOP+: cpu time17565.64: real time19907.05 LOOP+: cpu time15009.27: real time15473.92 LOOP+: cpu time16362.70: real time27032.38 LOOP+: cpu time20439.95: real time24267.30 LOOP+: cpu time 7985.91: real time 8122.31 ~~~~~ ~~~~~~ LOOP+: cpu time16603.43: real time16930.20 LOOP+: cpu time14694.33: real time14986.32 LOOP+: cpu time14642.99: real time35428.18 ~~~~~~ ~~~~~~ LOOP+: cpu time14783.55: real time15176.58 [ Last edited by mazuju028 on 2010-9-27 at 15:05 ] |
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nkleof(金币+1):谢谢参与
aylayl08(金币-1):禁止无意义回帖获取金币，扣回所得 2010-09-29 15:20:05
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2楼2010-09-28 10:19:50
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aylayl08(金币+2):感谢讨论 2010-09-29 19:10:14
aylayl08(金币+2):感谢讨论 2010-09-29 19:10:14
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应该没问题，但是注意你处理的能带数目尽可能的是你node的倍数。 说实话，我以前是用pwscf的，pwscf的并行方式好像和vasp的不太一样，pwscf要求k点的设置是node的倍数，因为pwscf是按K点的个数并行的。所以这个问题我也不是很清楚。不过我确实没遇到过你说的那种远大于的情况，一般real time会大一点，但是不会大太多，我是没遇到过超过10%的情况。也有可能是我一般算的体系都比较小。 [ Last edited by dxcharlary on 2010-9-29 at 19:09 ] |
8楼2010-09-29 19:03:45
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