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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】vasp中COOP如何理解及输出文件如何处理？
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

[交流] 【求助】vasp中COOP如何理解及输出文件如何处理？

手册68页6.33解LORBIT参数设置的时候讲到COOP计算。这个没理解。

呵呵，找了几篇文献，还不够。

希望得到以下帮助：

（1）vasp中COOP计算设置方法，输出文件数据处理方法（LORBIT=2,嗯）
（2）COOP的物理意义（图像）
（3）COOP基本概念或理论的教材或者原始文献

手册上讲：
If the LORBIT flag is not equal zero, the site and l-projected density of states is also calculated.

这个site projected是门么意思呢？ 分配到每个原子上去？
l-projectd 是进一步分解到s,p,d,f等原子轨道上去？

[ Last edited by cenwanglai on 2010-12-22 at 20:18 ]
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1楼 2010-12-22 10:50:44
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lgxyz

铜虫 (正式写手)
★
sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-12-22 21:49:40
manual上说coop和 the partial DOS projected onto molecular orbitals是一样的
具体怎么设置，还得请教！
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2楼2010-12-22 12:05:31
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
？？
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3楼2010-12-22 20:18:35
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zhangfan2192

金虫 (著名写手)
★
sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-12-22 21:49:30
cenwanglai(金币+3):嗯。看看去。 2010-12-23 09:03:34
如果我记得没错的话，霍夫曼的固体与表面一书中 有关于COOP的解释，用来分子成键作用的。
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4楼2010-12-22 21:37:53
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hchfox

木虫 (正式写手)
cenwanglai(金币+5):嗯，说的有理。那用什么来算COOP会比较可靠呢？ 2010-12-23 09:04:40
觉得不应再纠结从vasp如何得到coop了，意义有那么大吗？如果有，GK他们早就把它完善加进去了。现在是可得到，但可能你会发现vasp得到的coop可能不敢用，反正我以前的测试结果就是这样的。。。
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-12-22 10:50:44:
手册68页6.33解LORBIT参数设置的时候讲到COOP计算。这个没理解。

呵呵，找了几篇文献，还不够。

希望得到以下帮助：

（1）vasp中COOP计算设置方法，输出文件数据处理方法（LORBIT=2,嗯[/colo ...

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5楼2010-12-23 08:53:00
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hchfox

木虫 (正式写手)
★ ★
mazuju028(金币+2):谢谢交流 2010-12-23 09:32:46
cenwanglai(金币+2):呵呵，欢迎常来讨论。以后计算基础的讨论也希望你能来参与！ 2010-12-23 10:18:25
如果真想得到COOP，3.0版的SIESTA已可得到COOP和COHP了，另外TB-LMTO-ASA可得到COHP（估计这个代码现在不容易搞到手的），其他的免费代码Rspt（一种FP-LMTO代码）也可得到类似的COOP ---- BCOOP，ASW代码也可得到类似COOP曲线，但是商业程序，不公开。。。哈哈，COOP大杂烩了。。。。。
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6楼2010-12-23 09:20:21
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hakuna

木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★
ellsaking(金币+2):同疑惑~ 2010-12-23 09:45:23
cenwanglai(金币+2):呵呵，欢迎hakuna参与讨论。有空多来第一性原理分享指导。这里做理论催化的讨论深度有待提高。 2010-12-23 10:20:24
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2010-12-23 08:53:00:
觉得不应再纠结从vasp如何得到coop了，意义有那么大吗？如果有，GK他们早就把它完善加进去了。现在是可得到，但可能你会发现vasp得到的coop可能不敢用，反正我以前的测试结果就是这样的。。。


材料的和物理的可能对COOP没有太大兴趣，而化学的是有兴趣的，它能给出一个成键特性的直观表达，相比于物理人，化学人更喜欢直观......
KRESSE没有加它，我匿猜一下，因为他是物理出身的，如果他滑雪的话，没准就不用大家再讨论这个事情了......
你知道怎么得到COOP，不放给大家传授一下......
为什么从vasp结果得到的COOP不敢用，出了什么问题？
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7楼2010-12-23 09:22:45
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hchfox

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
ellsaking(金币+3):感谢详细解答~ 2010-12-23 09:45:59
呵呵，看来学化学的果真对COOP感兴趣啊。。。但你的猜测我不敢苟同，其实用VASP得COOP曲线的文章早在2000年左右都出来了，而且有一篇是PRL，但也就是那两三篇，而且都出自VASP开发组，之后就一直这个“搁浅”状态了，manual是有那样一句可完全得到COOP信息之类的话，这话还让一些国人抓耳挠腮，兴奋不已，非得干出COOP不可。COOP就那么重要吗？除了得出成键、反键之类的信息外，还有什么啊，不太懂这个。类似地，在VASP不已可得到ELF了吗？金属键、离子键、共价键都可分析出来了，还不能得到满足啊。。。

我以前从VASP得到COOP与用其他方法得到的COHP图像差异太大了（不仅仅是相反的概念），只好放弃了。当然，这也可能是我弄错了什么地方。
引用回帖:
Originally posted by hakuna at 2010-12-23 09:22:45:


材料的和物理的可能对COOP没有太大兴趣，而化学的是有兴趣的，它能给出一个成键特性的直观表达，相比于物理人，化学人更喜欢直观......
KRESSE没有加它，我匿猜一下，因为他是物理出身的，如果他滑雪的话，没 ...

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8楼2010-12-23 09:42:29
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hakuna

木虫 (知名作家)
★ ★ ★
zzy870720z(金币+3):鼓励讨论交流 2010-12-23 19:58:22
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2010-12-23 09:42:29:
呵呵，看来学化学的果真对COOP感兴趣啊。。。但你的猜测我不敢苟同，其实用VASP得COOP曲线的文章早在2000年左右都出来了，而且有一篇是PRL，但也就是那两三篇，而且都出自VASP开发组，之后就一直这个“搁浅”状态 ...

没错，COOP是早就出来，但后来少了是因为大家不知道怎么把它鼓捣出来了，以前那个orbidos配合德国人的ergrah可以得到coop，后来因为版权的原因，大家没办法在那么容易地得到COOP了，自然用得就少了。。。。
是啊，ELF可以表征一下共价键，离子键也可以通过电荷密度差和DOS去分析，但这些与COOP表征的意义还是有差别的......
VASP手册里那一句话，弄得多少人头疼不已....
其它基于第一原理的软件增加了计算coop的模块，但毕竟VASP占领的市场太大了，所以还是会有人关心vasp的coop。。
为什么滑雪人那么关注COOP呢？看看Hoffman早年发在angl...& REv. Mod. Phy.的两篇长文就会明白了，这两篇长文是那本固体与表面的主要内容....
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9楼2010-12-23 19:26:05
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lixiaowei

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
cenwanglai: 不清楚~~ 2012-02-20 16:33:21
现在楼主知道怎么得到COOP了吗？我现在也正在学习相关的只是，楼主知道怎么得到的话，麻烦说一下方法，谢谢！
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10楼2012-02-20 16:31:57
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冯亚娟

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by cenwanglai at 2010-12-22 20:18:35
？？

不知道楼主现在是否掌握VASP计算cohp？希望得到帮助~http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=10450813&fpage=1&target=blank
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11楼2016-07-02 13:39:28
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冯亚娟

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by hchfox at 2010-12-23 09:20:21
如果真想得到COOP，3.0版的SIESTA已可得到COOP和COHP了，另外TB-LMTO-ASA可得到COHP（估计这个代码现在不容易搞到手的），其他的免费代码Rspt（一种FP-LMTO代码）也可得到类似的COOP ---- BCOOP，ASW代码也可得到类 ...

不知道虫虫有没有看过cohp.de？里面涉及到lobster程序，说是可以与VASP结合，但是实际应用中遇到问题，希望得到帮助！http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=10450813&fpage=1&target=blank
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12楼2016-07-02 13:41:51
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冯亚娟

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangfan2192 at 2010-12-22 21:37:53
如果我记得没错的话，霍夫曼的固体与表面一书中 有关于COOP的解释，用来分子成键作用的。

不知道虫虫是否解决vasp与cohp结合的问题，希望得到帮助http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=10450813&fpage=1&target=blank~
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13楼2016-07-02 13:43:18
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