| 查看: 5117 | 回复: 19 | ||
point_light铁虫 (小有名气)
|
[求助]
ＶＡＳＰ计算出错，请高手指点
|
|
|
我计算的是ＧａＡｓ掺Ｍｎ的超胞静态计算，然后就出了这个问题，不知道怎么搞，我是新手，请高手指点，谢谢 ===================================================================================== = BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES = EXIT CODE: 9 = CLEANING UP REMAINING PROCESSES = YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES ===================================================================================== APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Killed (signal 9) [dong@node04 7]$ Write failed: Broken pipe |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
范二青年» 猜你喜欢
323求调剂
已经有6人回复
-
一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂
已经有4人回复
-
352求调剂
已经有3人回复
-
一志愿东华大学化学070300，求调剂
已经有8人回复
-
277材料科学与工程080500求调剂
已经有7人回复
-
317求调剂
已经有18人回复
-
293求调剂
已经有5人回复
-
280分求调剂 一志愿085802
已经有7人回复
-
0854电子信息求调剂
已经有3人回复
-
263求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- VASP并行计算出错
已经有9人回复
- spin-orbit计算求助！
已经有15人回复
- ADF计算自旋轨道耦合
已经有7人回复
- vasp计算静态出现错误！
已经有5人回复
- vasp计算在进行静态计算时，出错。
已经有3人回复
- VASP计算时的几个细节设置问题，希望有经验的人过来指点一下！
已经有23人回复
- 【求助】vasp计算过渡态结果出错
已经有17人回复
- 【求助】vasp静态计算能量值错误
已经有21人回复
- 【求助】vasp优化晶格参数a
已经有13人回复
- 【求助】VASP计算cluster出错！
已经有5人回复
- 【整理】《提问的智慧》——献给那些不会提问的人
已经有78人回复
- 【求助】PBE0 计算Si、Ge能带结构
已经有9人回复
point_light
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 13.8
- 散金: 10
- 红花: 5
- 帖子: 77
- 在线: 42.2小时
- 虫号: 1092037
- 注册: 2010-09-07
- 专业: 电磁场与波
11楼2012-05-09 16:54:38
point_light
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 13.8
- 散金: 10
- 红花: 5
- 帖子: 77
- 在线: 42.2小时
- 虫号: 1092037
- 注册: 2010-09-07
- 专业: 电磁场与波
2楼2012-05-08 09:39:28
dxf_dxf_dxf
银虫 (小有名气)
- 1ST强帖: 4
- 应助: 15 (小学生)
- 金币: 269.1
- 红花: 3
- 帖子: 104
- 在线: 29.1小时
- 虫号: 1449737
- 注册: 2011-10-19
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
3楼2012-05-08 17:36:24
hn19870519
木虫 (正式写手)
- 1ST强帖: 1
- 应助: 45 (小学生)
- 金币: 1225.2
- 散金: 1861
- 红花: 11
- 帖子: 379
- 在线: 203.1小时
- 虫号: 867945
- 注册: 2009-10-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
4楼2012-05-08 17:39:09
dxf_dxf_dxf
银虫 (小有名气)
- 1ST强帖: 4
- 应助: 15 (小学生)
- 金币: 269.1
- 红花: 3
- 帖子: 104
- 在线: 29.1小时
- 虫号: 1449737
- 注册: 2011-10-19
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
5楼2012-05-08 17:39:21
condensed
木虫 (著名写手)
- 应助: 21 (小学生)
- 金币: 3223.5
- 散金: 44
- 红花: 3
- 帖子: 1002
- 在线: 208.4小时
- 虫号: 292567
- 注册: 2006-11-04
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
【答案】应助回帖
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-05-09 08:42:35
贺仪: 金币+1, 谢谢指教！ 2012-05-09 09:44:22
point_light: 金币+1, ★★★很有帮助, the reason is that the supercell is too large and the precision is too high 2012-05-12 16:51:13
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-05-09 08:42:35
贺仪: 金币+1, 谢谢指教！ 2012-05-09 09:44:22
point_light: 金币+1, ★★★很有帮助, the reason is that the supercell is too large and the precision is too high 2012-05-12 16:51:13
|
I think the supercell is too large for the MEM of your machine. You know that the symmetry is very low for the doped structure. Please show how many atoms in your supercell, KPOINTS and the basic information of your machine. |
6楼2012-05-09 06:40:00
point_light
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 13.8
- 散金: 10
- 红花: 5
- 帖子: 77
- 在线: 42.2小时
- 虫号: 1092037
- 注册: 2010-09-07
- 专业: 电磁场与波
|
首先感谢大家的关注。 我的POSCAR是： Ga(0.963)Mn(0.037)As 1.0 -8.480250000000000 -0.000000000000002 -8.480249999999996 -8.480250000000003 8.480249999999995 0.000000000000007 -0.000000000000006 8.480250000000002 -8.480249999999995 1 26 27 D -0.7500000000000000 0.2500000000000000 0.2500000000000000 -0.4166666666666667 -0.0833333333333334 0.2500000000000002 -0.0833333333333335 -0.4166666666666667 0.2500000000000001 0.2500000000000002 0.2500000000000001 -0.4166666666666668 0.2500000000000001 0.2500000000000001 -0.0833333333333335 0.2500000000000001 -0.4166666666666667 -0.0833333333333335 0.2500000000000001 -0.0833333333333334 -0.4166666666666667 -0.4166666666666667 0.2500000000000001 0.2500000000000001 -0.0833333333333334 0.2500000000000000 0.2500000000000001 -0.0833333333333335 0.2500000000000001 -0.4166666666666667 -0.4166666666666667 0.2500000000000001 -0.0833333333333335 0.2500000000000001 -0.4166666666666667 0.2500000000000002 0.2500000000000001 -0.0833333333333334 0.2500000000000001 -1.4166666666666667 0.5833333333333329 0.2500000000000002 0.5833333333333328 -1.4166666666666667 0.5833333333333337 0.2500000000000003 0.5833333333333338 -1.4166666666666670 0.5833333333333336 0.2500000000000002 0.5833333333333329 -1.0833333333333335 -0.0833333333333333 0.2500000000000001 -0.0833333333333335 -1.0833333333333335 0.9166666666666670 0.2500000000000001 0.9166666666666669 -1.0833333333333335 0.9166666666666669 0.2500000000000000 -0.0833333333333334 -1.0833333333333335 -0.0833333333333338 0.5833333333333338 0.5833333333333338 0.5833333333333336 -1.0833333333333337 0.5833333333333337 -1.0833333333333335 -0.0833333333333338 -1.0833333333333335 0.5833333333333337 0.5833333333333336 -0.0833333333333338 0.5833333333333338 -1.0833333333333337 0.5833333333333335 -1.0833333333333335 0.5833333333333338 -0.1666666666666668 -0.1666666666666667 0.1666666666666668 0.1666666666666668 0.1666666666666668 -0.1666666666666668 0.1666666666666668 -0.1666666666666668 -0.1666666666666668 -0.1666666666666668 0.1666666666666668 0.1666666666666667 -0.1666666666666667 0.1666666666666668 -0.1666666666666668 0.1666666666666668 -0.1666666666666668 0.1666666666666668 -0.4999999999999999 0.1666666666666667 0.1666666666666667 0.1666666666666666 -0.4999999999999999 0.1666666666666667 0.1666666666666667 0.1666666666666666 -0.5000000000000000 0.1666666666666666 0.1666666666666667 0.1666666666666666 -0.4999999999999999 -0.1666666666666669 0.1666666666666668 -0.1666666666666669 -0.5000000000000000 0.5000000000000001 0.1666666666666669 0.5000000000000001 -0.5000000000000000 0.5000000000000000 0.1666666666666668 -0.1666666666666669 0.1666666666666668 -0.4999999999999999 -0.1666666666666668 0.5000000000000000 -0.1666666666666669 -0.4999999999999999 -0.4999999999999999 0.1666666666666668 0.5000000000000001 -0.1666666666666669 0.5000000000000000 0.1666666666666668 -0.1666666666666669 0.1666666666666669 -0.4999999999999999 -0.4999999999999999 0.5000000000000000 -0.1666666666666669 0.5000000000000000 -0.4999999999999999 0.1666666666666668 0.1666666666666668 -0.1666666666666669 0.5000000000000000 -1.1666666666666667 -0.1666666666666667 0.5000000000000004 -0.1666666666666669 -1.1666666666666667 0.8333333333333333 0.5000000000000004 0.8333333333333333 -1.1666666666666670 0.8333333333333333 0.5000000000000002 -0.1666666666666668 -1.5000000000000000 0.5000000000000000 0.5000000000000001 我的INCAR是： SYSTEM =ureaf # Startparameter for this Run: # NWRITE = 2; LPETIM=F write-flag & timer ISTART = 1 job : 0-new 1-cont 2-samecut ISPIN = 2 spin polarized calculation? # ttISPIN = 1 spin polarized calculation? # MAGMOM = 5 -5 46*0 # NPAR = 1 # LAECHG = .TRUE. RWIGS = 1.7199 1.8226 1.5756 LPLANE = .TRUE. # LSCALU = .FALSE. # SAXIS = 0 0 1 NBANDS = 200 # LORBMOM = .TRUE. # LSORBIT = .TRUE. ICHARG = 11 # LNONCOLLINEAR = .TRUE. # NSIM = 4 # LWAVE = .FALSE. LORBIT =11 PREC=Accurate # Electronic Relaxation 1 ENCUT = 500 eV IALGO = 48 LREAL = .TRUE. # NELMIN = 2 # BMIX = 2.0 NELM = 1; # NELMDL = 5 EDIFF =1E-05 # EDIFFG= -1E-2 # Ionic Relaxation # ISYM = 2 # NSW = 300 number of steps for IOM # NBLOCK = 1; KBLOCK = 20 inner block; outer block # IBRION = 2 ionic relax: 0-MD 1-quasi-New 2-CG # ISIF = 2 stress and relaxation # SMASS = 2.0 # POTIM = 1.00 # TEBEG 573 # ttIBRION = 2 ionic relax: 0-MD 1-quasi-New 2-CG # ttISIF = 7 stress and relaxation # ttISYM = 1 # IWAVPR = 1 prediction: 0-non 1-charg 2-wave 3-comb # LCORR = T Harris-correction to forces # POTIM = 0.2 time-step for ion-motion # TEBEG = 0.0 ; TEEND= 0.0 initial temperature # DOS related values: ISMEAR = 0 ; SIGMA = 0.2 : broadening in eV -4-tet -1-fermi 0-gaus 我的kpoints是用的面心立方结构，但是MS中显示的是三斜，我又没有三斜的KPOINTS文件，所以没有试。下面是面心立方结构的KPOINTS： K-pints fcc G-X-W-L-G-K-X 100 ! intersections Line-mode rec 0.00 0.00 0.00 !gamma 0.50 0.00 0.50 !X 0.50 0.00 0.50 !X 0.50 0.25 0.75 !W 0.50 0.25 0.75 !W 0.50 0.50 0.50 !L 0.50 0.50 0.50 !L 0.00 0.00 0.00 !gamma 0.00 0.00 0.00 !gamma 0.75 0.375 0.375 !K 0.75 0.375 0.375 !K 0.50 0.00 0.50 !X 以前提的问题好像是服务器问题，老师帮我解决了，现在算的时候（用4个或8个CPU）总是出现内存不足，我用12个CPU算又出了其他问题，我想这肯定不是内存不足的原因，估计是哪里设置不对，INCAR或KPOINTS的问题，我是刚开始学这些，希望大家帮我看看。 |
7楼2012-05-09 15:40:30
point_light
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 13.8
- 散金: 10
- 红花: 5
- 帖子: 77
- 在线: 42.2小时
- 虫号: 1092037
- 注册: 2010-09-07
- 专业: 电磁场与波
|
首先感谢大家的关注。 我的POSCAR是： Ga(0.963)Mn(0.037)As 1.0 -8.480250000000000 -0.000000000000002 -8.480249999999996 -8.480250000000003 8.480249999999995 0.000000000000007 -0.000000000000006 8.480250000000002 -8.480249999999995 1 26 27 D -0.7500000000000000 0.2500000000000000 0.2500000000000000 -0.4166666666666667 -0.0833333333333334 0.2500000000000002 -0.0833333333333335 -0.4166666666666667 0.2500000000000001 0.2500000000000002 0.2500000000000001 -0.4166666666666668 0.2500000000000001 0.2500000000000001 -0.0833333333333335 0.2500000000000001 -0.4166666666666667 -0.0833333333333335 0.2500000000000001 -0.0833333333333334 -0.4166666666666667 -0.4166666666666667 0.2500000000000001 0.2500000000000001 -0.0833333333333334 0.2500000000000000 0.2500000000000001 -0.0833333333333335 0.2500000000000001 -0.4166666666666667 -0.4166666666666667 0.2500000000000001 -0.0833333333333335 0.2500000000000001 -0.4166666666666667 0.2500000000000002 0.2500000000000001 -0.0833333333333334 0.2500000000000001 -1.4166666666666667 0.5833333333333329 0.2500000000000002 0.5833333333333328 -1.4166666666666667 0.5833333333333337 0.2500000000000003 0.5833333333333338 -1.4166666666666670 0.5833333333333336 0.2500000000000002 0.5833333333333329 -1.0833333333333335 -0.0833333333333333 0.2500000000000001 -0.0833333333333335 -1.0833333333333335 0.9166666666666670 0.2500000000000001 0.9166666666666669 -1.0833333333333335 0.9166666666666669 0.2500000000000000 -0.0833333333333334 -1.0833333333333335 -0.0833333333333338 0.5833333333333338 0.5833333333333338 0.5833333333333336 -1.0833333333333337 0.5833333333333337 -1.0833333333333335 -0.0833333333333338 -1.0833333333333335 0.5833333333333337 0.5833333333333336 -0.0833333333333338 0.5833333333333338 -1.0833333333333337 0.5833333333333335 -1.0833333333333335 0.5833333333333338 -0.1666666666666668 -0.1666666666666667 0.1666666666666668 0.1666666666666668 0.1666666666666668 -0.1666666666666668 0.1666666666666668 -0.1666666666666668 -0.1666666666666668 -0.1666666666666668 0.1666666666666668 0.1666666666666667 -0.1666666666666667 0.1666666666666668 -0.1666666666666668 0.1666666666666668 -0.1666666666666668 0.1666666666666668 -0.4999999999999999 0.1666666666666667 0.1666666666666667 0.1666666666666666 -0.4999999999999999 0.1666666666666667 0.1666666666666667 0.1666666666666666 -0.5000000000000000 0.1666666666666666 0.1666666666666667 0.1666666666666666 -0.4999999999999999 -0.1666666666666669 0.1666666666666668 -0.1666666666666669 -0.5000000000000000 0.5000000000000001 0.1666666666666669 0.5000000000000001 -0.5000000000000000 0.5000000000000000 0.1666666666666668 -0.1666666666666669 0.1666666666666668 -0.4999999999999999 -0.1666666666666668 0.5000000000000000 -0.1666666666666669 -0.4999999999999999 -0.4999999999999999 0.1666666666666668 0.5000000000000001 -0.1666666666666669 0.5000000000000000 0.1666666666666668 -0.1666666666666669 0.1666666666666669 -0.4999999999999999 -0.4999999999999999 0.5000000000000000 -0.1666666666666669 0.5000000000000000 -0.4999999999999999 0.1666666666666668 0.1666666666666668 -0.1666666666666669 0.5000000000000000 -1.1666666666666667 -0.1666666666666667 0.5000000000000004 -0.1666666666666669 -1.1666666666666667 0.8333333333333333 0.5000000000000004 0.8333333333333333 -1.1666666666666670 0.8333333333333333 0.5000000000000002 -0.1666666666666668 -1.5000000000000000 0.5000000000000000 0.5000000000000001 我的INCAR是： SYSTEM =ureaf # Startparameter for this Run: # NWRITE = 2; LPETIM=F write-flag & timer ISTART = 1 job : 0-new 1-cont 2-samecut ISPIN = 2 spin polarized calculation? # ttISPIN = 1 spin polarized calculation? # MAGMOM = 5 -5 46*0 # NPAR = 1 # LAECHG = .TRUE. RWIGS = 1.7199 1.8226 1.5756 LPLANE = .TRUE. # LSCALU = .FALSE. # SAXIS = 0 0 1 NBANDS = 200 # LORBMOM = .TRUE. # LSORBIT = .TRUE. ICHARG = 11 # LNONCOLLINEAR = .TRUE. # NSIM = 4 # LWAVE = .FALSE. LORBIT =11 PREC=Accurate # Electronic Relaxation 1 ENCUT = 500 eV IALGO = 48 LREAL = .TRUE. # NELMIN = 2 # BMIX = 2.0 NELM = 1; # NELMDL = 5 EDIFF =1E-05 # EDIFFG= -1E-2 # Ionic Relaxation # ISYM = 2 # NSW = 300 number of steps for IOM # NBLOCK = 1; KBLOCK = 20 inner block; outer block # IBRION = 2 ionic relax: 0-MD 1-quasi-New 2-CG # ISIF = 2 stress and relaxation # SMASS = 2.0 # POTIM = 1.00 # TEBEG 573 # ttIBRION = 2 ionic relax: 0-MD 1-quasi-New 2-CG # ttISIF = 7 stress and relaxation # ttISYM = 1 # IWAVPR = 1 prediction: 0-non 1-charg 2-wave 3-comb # LCORR = T Harris-correction to forces # POTIM = 0.2 time-step for ion-motion # TEBEG = 0.0 ; TEEND= 0.0 initial temperature # DOS related values: ISMEAR = 0 ; SIGMA = 0.2 : broadening in eV -4-tet -1-fermi 0-gaus 我的kpoints是用的面心立方结构，但是MS中显示的是三斜，我又没有三斜的KPOINTS文件，所以没有试。下面是面心立方结构的KPOINTS： K-pints fcc G-X-W-L-G-K-X 100 ! intersections Line-mode rec 0.00 0.00 0.00 !gamma 0.50 0.00 0.50 !X 0.50 0.00 0.50 !X 0.50 0.25 0.75 !W 0.50 0.25 0.75 !W 0.50 0.50 0.50 !L 0.50 0.50 0.50 !L 0.00 0.00 0.00 !gamma 0.00 0.00 0.00 !gamma 0.75 0.375 0.375 !K 0.75 0.375 0.375 !K 0.50 0.00 0.50 !X 以前提的问题好像是服务器问题，老师帮我解决了，现在算的时候（用4个或8个CPU）总是出现内存不足，我用12个CPU算又出了其他问题，我想这肯定不是内存不足的原因，估计是哪里设置不对，INCAR或KPOINTS的问题，我是刚开始学这些，希望大家帮我看看。 |
8楼2012-05-09 15:40:46
point_light
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 13.8
- 散金: 10
- 红花: 5
- 帖子: 77
- 在线: 42.2小时
- 虫号: 1092037
- 注册: 2010-09-07
- 专业: 电磁场与波
|
我是刚接触这些，你说的我看不懂，就给你OUTCAR最后几行，帮我看看吧，谢谢了  。我算了2个结构，得到2个OUTCAR,但都没算成功，第一步算完就结束了，最后几行如下： 1.maximum and minimum number of plane-waves per node : 31026 30857 maximum number of plane-waves: 31026 maximum index in each direction: IXMAX= 21 IYMAX= 21 IZMAX= 21 IXMIN= -22 IYMIN= -22 IZMIN= -22 NGX is ok and might be reduce to 88 NGY is ok and might be reduce to 88 NGZ is ok and might be reduce to 88 serial 3D FFT for wavefunctions parallel 3D FFT for charge: minimum data exchange during FFTs selected (reduces bandwidth) 4226,0-1 底端 2.这个最后只有这些： k-point ** : 0.56280.09420.4686 plane waves: 30978 k-point ** : 0.56160.09230.4692 plane waves: 30972 k-point ** : 0.56030.09050.4698 plane waves: 30976 k-point ** : 0.55900.08860.4705 plane waves: 30980 k-point ** : 0.55780.08670.4711 plane waves: 30978 k-point ** : 0.55650.0848 |
9楼2012-05-09 15:47:14
point_light
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 13.8
- 散金: 10
- 红花: 5
- 帖子: 77
- 在线: 42.2小时
- 虫号: 1092037
- 注册: 2010-09-07
- 专业: 电磁场与波
10楼2012-05-09 15:51:33
