24小时热门版块排行榜    

查看: 3294  |  回复: 23

vasp_wien2k

新虫 (初入文坛)

[求助] vasp串行,并行编译成功,但很奇怪。 已有4人参与

在同样的机子上,同样的系统上,分别进行串行和并行编译vasp5.2,最终均可使用。
但同样的任务,并行耗时却总是串行的2倍,无论是串行耗时几十秒的任务或者串行耗时1个小时的任务。

硬件:双核笔记本四线程,32位ubuntu,
不知原因,请指教。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-01-20 07:41:02
vasp_wien2k: 金币+15, ★★★很有帮助 2014-01-20 20:29:32
影响串并行效率的因素很多
你多试几个不同的example来测试对比一下
2楼2014-01-19 15:11:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
祝福 祝福
3楼2014-01-19 15:25:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lchchl

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-01-20 07:41:07
这种情况很有可能的,核与核之间的通信速度当然是不如单核之内的通信速度,可能你所测试的列子中主要的耗时就在这里!
为什么小木虫每天都是扣四个金币!!!!!!
4楼2014-01-19 16:00:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vasp_wien2k

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by emilyoyang at 2014-01-19 15:11:53
影响串并行效率的因素很多
你多试几个不同的example来测试对比一下

已经试了好几个任务了,并行耗时均是串行耗时的2.5倍,关键是也差不多都是这个样子的,没有例外的。而且从优化后的CONTCAR看,结果基本相同。
5楼2014-01-19 22:00:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vasp_wien2k

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lchchl at 2014-01-19 16:00:29
这种情况很有可能的,核与核之间的通信速度当然是不如单核之内的通信速度,可能你所测试的列子中主要的耗时就在这里!

谢谢!
我也一度这么一厢情愿的认为,可是结果总是让我难以接受..............
6楼2014-01-19 22:02:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
vasp_wien2k: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-01-20 20:27:58
并行是怎么执行的?
并行执行错误变成了串行好几遍是最常见的情况。
7楼2014-01-20 07:18:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

风间的记忆

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
vasp_wien2k: 金币+25, ★★★很有帮助 2014-01-20 20:28:24
LS那位 核内交换肯定比核外交换速度快的同学
这串行的任务就一个核计算 需要交换什么呢?
而且数据在核里吗?
基本的计算机知识都不懂
-------------------------------------
回答LS问题
你是不是开了超线程
如果是 关了 再试试
九州浩淼,任其东西,明日何在,但随我意。
8楼2014-01-20 09:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emilyoyang

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 风间的记忆 at 2014-01-20 09:17:57
LS那位 核内交换肯定比核外交换速度快的同学
这串行的任务就一个核计算 需要交换什么呢?
而且数据在核里吗?
基本的计算机知识都不懂
-------------------------------------
回答LS问题
你是不是开了超线程 ...

Nice, 可能是这个原因
9楼2014-01-20 10:27:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vasp_wien2k

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by KalaShayminS at 2014-01-20 07:18:56
并行是怎么执行的?
并行执行错误变成了串行好几遍是最常见的情况。

intel 双核cpu,4线程
串行使用vasp命令,top命令下可以看到一个cpu显示100%,另外三个cpu显示基本0.
并行使用mpiexec -np 4 vasp,top命令下可以看到四个cpu同时显示100%,计算结果每次在屏幕上显示4个一样的结果。

不知道以上是否描述清楚?
觉得会不会是楼上几位说的我将并行执行错误变成了串行好几遍。
10楼2014-01-20 20:09:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 vasp_wien2k 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 294求调剂材料与化工专硕 +9 陌の森林 2026-03-18 9/450 2026-03-19 11:12 by kakakapanpan
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +5 枫桥ZL 2026-03-18 5/250 2026-03-19 11:08 by kakakapanpan
[考研] 332求调剂 +3 ydfyh 2026-03-17 3/150 2026-03-19 10:14 by 功夫疯狂
[考研] 求材料调剂 +10 隔壁陈先生 2026-03-12 10/500 2026-03-19 09:15 by 无际的草原
[考研] 085410人工智能专硕317求调剂(0854都可以) +3 xbxudjdn 2026-03-18 3/150 2026-03-18 22:14 by zhq0425
[考研] 330求调剂 +3 小材化本科 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:55 by 无懈可击111
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +5 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 6/300 2026-03-18 17:53 by 无际的草原
[考研] 266求调剂 +5 阳阳哇塞 2026-03-14 9/450 2026-03-18 15:05 by stone_128
[考研] 297求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-17 8/400 2026-03-18 14:30 by laoshidan
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +7 ZY-05 2026-03-13 8/400 2026-03-18 14:13 by 007_lilei
[考研] 304求调剂 +12 小熊joy 2026-03-14 13/650 2026-03-18 12:34 by Linda Hu
[考研] 085600材料与化工求调剂 +5 绪幸与子 2026-03-17 5/250 2026-03-17 16:40 by laoshidan
[考研] 26考研求调剂 +6 丶宏Sir 2026-03-13 6/300 2026-03-17 16:13 by 醉在风里
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 085600材料与化工 求调剂 +13 enenenhui 2026-03-13 14/700 2026-03-16 15:19 by 了了了了。。
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
信息提示
请填处理意见