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043114076

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dl_poly segmentation fault已有2人参与

只是在进行optimization 才会出现segmentation fault。并且同一个任务在同一个地方报错，不同的任务在不同的地方报错。
除了optimization，其他任务都没有报错。
在网上查了很多解决方法，但都似懂非懂。

[ Last edited by 043114076 on 2010-5-21 at 12:13 ]
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1楼2010-05-21 12:12:11
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-21 16:43:19
你这样提问基本上是无效的提问。也不知道为什么现在问问题都是这样简单，做的是什么体系都不舍得说，每次都要先说“请把input script和出错信息贴出来”，才能继续交流。
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2楼2010-05-21 16:17:20
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043114076

木虫 (正式写手)
谢谢大王提醒，确实有点太随意了。
我模拟的是bmimPF6离子液体，阴粒子是rigid body，阳离子只有二面角可以动。使用UA势。体系共有4250个原子。
CONTROL文件如下：
optim force      1.0
steps               1000
print                  1
stack                 10
stats                  1
timestep           0.0001
cutoff               22.0
rvdw                 20.0
delr                 0.5
spme precision    1.0E-6
shake tolerance 1.0E-5
job time       1000000.0
close time         100.0
quaternion 1.0e-6
finish

OUTPUT文件没有错误信息。
只在终端显示Segmentation fault。

[ Last edited by 043114076 on 2010-5-21 at 16:35 ]
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3楼2010-05-21 16:31:59
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-21 19:25:00
先不用OPTIMIZE，走一个NVE试试看。
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4楼2010-05-21 19:24:03
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-05-21 19:24:03:
先不用OPTIMIZE，走一个NVE试试看。

已经尝试过了，还是不行。我先用zero 跑了2000步，然后做的optimize。
手册中说，如果opt有问题，可能是编译器的问题，我用的gcc编译器。
还有人说是系统堆栈设置太小了，但是问题是程序并不是不能运行，而是运行到某一步停的，所以好像不是这个问题。
不知大王有什么建议？谢谢
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5楼2010-05-21 22:30:41
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+5):谢谢 2010-05-22 10:34:56
1. 有限初始温度（比如300K）下，走NVE，看看有没有出错信息。
2.  不用opti force，换个优化方法试试，看看有没有出错信息。
3. 用OPTI force，换个参数看看。


多试一试，找找出错原因，把原因找出来才好办。

你说程序并不是不能运行，而是运行到某一步停的，那么把前面的输出信息好好分析一下，它是没有任何征兆，上一步正常，下一步就立刻不行了，还是慢慢的不行？
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6楼2010-05-22 10:06:48
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043114076

木虫 (正式写手)
好的，我在看看。
看来学习程序是个细致活
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7楼2010-05-22 18:04:56
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