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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » ssh上运行程序出现segmentation fault
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kevin123581

金虫 (正式写手)

[求助] ssh上运行程序出现segmentation fault

同样的程序我pc能运行，当把数组改小了在ssh也能运行，但是吧数组改回来在ssh就会出现segmentation fault这个错误，网上说是stack size的问题，但是我用ulimit -a 查看了stack size时候ulimited，我试着修改了下也改不了。
有朋友遇到过这样的问题么？
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1楼 2012-08-22 13:09:03
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liuhuisfp

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
csgt0: 金币+1, 多谢应助 2012-08-22 14:10:53
我也遇到过ulimit -s改不了的问题，你退出登陆或者再开一个窗口登陆服务器，用 ulimit -s改一个比较大一点的数应该是可以的。

如果实在不行，你应该用调试器确认一下是否堆大小不够引起的错误。
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2楼2012-08-22 14:03:11
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kevin123581

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuhuisfp at 2012-08-22 14:03:11
我也遇到过ulimit -s改不了的问题，你退出登陆或者再开一个窗口登陆服务器，用 ulimit -s改一个比较大一点的数应该是可以的。

如果实在不行，你应该用调试器确认一下是否堆大小不够引起的错误。

都不行，我不晓得是不是ssh不能修改，以为我实在工作站算的。堆大小不够什么意思？  我现在 150x150x150的都不行。。。     50x50x50的可以
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3楼2012-08-22 14:22:48
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liuhuisfp

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
kevin123581: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-08-22 17:10:41
csgt0: 金币+2, 多谢应助 2012-08-23 09:15:14
引用回帖:
3楼: Originally posted by kevin123581 at 2012-08-22 14:22:48
都不行，我不晓得是不是ssh不能修改，以为我实在工作站算的。堆大小不够什么意思？  我现在 150x150x150的都不行。。。     50x50x50的可以...

不好意思，说错了，上面的应该是栈大小(stack size)。
栈是程序静态分配的内存空间，有大小限制，如果静态数组太大（栈溢出），就会引起“segmentation fault”。但是“segmentation fault”的原因非常多，未必是栈溢出。
堆是程序运行时动态分配的内存空间，即用malloc, calloc等分配的，大小几乎没有限制。

首先，不可能是SSH引起的问题，SSH只是一种加密的安全通讯方式。
你的数组为150x150x150，假定为doulbe * 8，需要的空间为150*150*150*8/1024/1024 = 26M，所以栈大小必须大于26M（最好多些）。

解决办法：
1. 还是上面说的，用ulimit -s 改一个大点的值试试。一般服务器上应该不会限制用户调整这个参数的，如果不行问下管理员看看怎么回事。如图，我们服务器上也是unlimited，可以改。
2.改用动态分配数组的空间。即用malloc来分配，fortran不太清楚怎么动态分配。
3.还不行，说明是程序其它部分的问题，开gdb调试吧。
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4楼2012-08-22 15:59:46
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kevin123581

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liuhuisfp at 2012-08-22 15:59:46
不好意思，说错了，上面的应该是栈大小(stack size)。
栈是程序静态分配的内存空间，有大小限制，如果静态数组太大（栈溢出），就会引起“segmentation fault”。但是“segmentation fault”的原因非常多，未必是 ...

恩 谢谢   找到解决方法了
编译前先输入
ulimit -s unlimited
KMP_STACKSIZE=**********
就可以了   谢谢
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5楼2012-08-22 17:10:21
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kevin123581

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liuhuisfp at 2012-08-22 15:59:46
不好意思，说错了，上面的应该是栈大小(stack size)。
栈是程序静态分配的内存空间，有大小限制，如果静态数组太大（栈溢出），就会引起“segmentation fault”。但是“segmentation fault”的原因非常多，未必是 ...

我那个数组还是不够，还是得计算更大的，这时候就会出现
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
run.x              000000000040032F  Unknown               Unknown  Unknown
run.x              00000000004002EC  Unknown               Unknown  Unknown
run.x              00000000004EB780  Unknown               Unknown  Unknown
run.x              00000000004001B9  Unknown               Unknown  Unknown
这个错误，我怀疑是数组过大，超出了计算机内存。
但是算下来又没有。按照你的说法，我600*600*600的数组，算出来大概1.6G，
但是我的stacksize设置的时候是999999999（9位），所以肯定是够的。 计算机方面，8core的大概16G，所以也该是够的啊？ 我里面有很多的数组，是不是该加起来呢？   那估计是超过了16G的。
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6楼2012-09-11 15:44:24
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yinzh

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by kevin123581 at 2012-08-22 17:10:21
恩 谢谢   找到解决方法了
编译前先输入
ulimit -s unlimited
KMP_STACKSIZE=**********
就可以了   谢谢...

楼主太强了，困扰了我很长时间的问题，看到你的帖子就轻而易举的给解决了
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坚持学习
7楼2015-04-14 20:53:34
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