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caojinli

金虫 (初入文坛)

[求助] VASP中PBS的脚本文件关于mpirun的看不懂 哪位大神帮忙解决解决 已有2人参与

我们服务器的PBS脚本文件:
#PBS -l nodes=1:ppn=16
#PBS -j oe
cd $PBS_O_WORKDIR
NSLOTS=`cat ${PBS_NODEFILE} | wc -l`
mpirun -np $NSLOTS -machinefile $PBS_NODEFILE /data1/soft/bin/vasp.openmpi
前三行都能看懂,后面两行(路径除外)看不懂什么意思,哪位大神帮帮忙??求解答
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纳兰嫣然

至尊木虫 (著名写手)

哈哈哈哈大会规范和规范
苦乐随缘,心无增减!
5楼2015-06-17 14:27:18
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查看全部 5 个回答

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
caojinli: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-06-17 08:41:49
进入到执行程序的文件夹
计算进程数
mpirun启动vasp程序
2楼2015-06-16 23:31:42
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caojinli

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by KalaShayminS at 2015-06-16 23:31:42
进入到执行程序的文件夹
计算进程数
mpirun启动vasp程序

NSLOTS=`cat ${PBS_NODEFILE} | wc -l`
mpirun -np $NSLOTS -machinefile $PBS_NODEFILE
这两行里面第一行是命名变量吗?第二行是什么??
3楼2015-06-17 08:43:26
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wmy8802217

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by caojinli at 2015-06-17 08:43:26
NSLOTS=`cat ${PBS_NODEFILE} | wc -l`
mpirun -np $NSLOTS -machinefile $PBS_NODEFILE
这两行里面第一行是命名变量吗?第二行是什么??...

第一行是得到多少个核并行,-machinefile 我估计是指定哪个节点运行
凝聚态理论与计算物理
4楼2015-06-17 08:58:54
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