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fdd096030079

新虫 (小有名气)

[交流] vasp中,做截断能测试时,测试收敛的标准已有5人参与

在做截断能测试时,测试收敛的标准是什么呢?
我看到候博士的手册上说的时总能量相差小于0.001eV时,就说是已经收敛了,但我最近做的NaAlH4的超胞,96个原子,很难收敛到0.001eV,因此,我想是不是候博士那个地方说的不够清楚,应该是平均每个原子的能量相差0.001eV,而不是总能量。后来,我问导师,导师说是按照总能量的,但我觉得这样不合理啊~如何一个大的体系,要求总能量的变化在0.001eV,那不是很困难吗?本来体系大的话就难以计算,还哪能要求这么严格?因此,带着这个疑问,我想在这里跟大家交流一下,到底是总能量还是平均每个原子的能量,希望有经验的虫友勇于发言啊~
这是我计算结果曲线,虽然都计算到了800eV,但总能量还没有达到0.001eV。


[ Last edited by fdd096030079 on 2012-12-5 at 09:41 ]
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ifmc1234

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
0.01 eV应该就够了,你上面的数据显示,应该选400或者450就够了
2楼2012-12-05 15:36:19
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微6凉

铁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by fdd096030079 at 2014-11-13 09:25:28
仅供参考哦:
#PBS -N bulk-encut
#PBS -j oe
#PBS -l nodes=1:ppn=16
#PBS -l walltime=120:00:00
#PBS -q low

cd $PBS_O_WORKDIR
NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`

for en in 300 350 400 450 500 550  ...

我想请问您这个脚本是如何运行的呢
10楼2015-09-02 16:33:14
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普通回帖

fdd096030079

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ifmc1234 at 2012-12-05 15:36:19
0.01 eV应该就够了,你上面的数据显示,应该选400或者450就够了

也就是说,这个截断能没有一个标准,根据测试曲线上的趋势来判定j截断能了?比如,上面这个曲线,在450eV或500eV以后,能量基本趋于稳定就可以了~我这种想法对不对呢?
3楼2012-12-05 22:12:03
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ifmc1234

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by fdd096030079 at 2012-12-05 22:12:03
也就是说,这个截断能没有一个标准,根据测试曲线上的趋势来判定j截断能了?比如,上面这个曲线,在450eV或500eV以后,能量基本趋于稳定就可以了~我这种想法对不对呢?...

可以这么理解,当然,不能单独只看一个参数来判别。对于k点的选择等,都需要考虑。
4楼2012-12-06 21:16:09
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fdd096030079

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ifmc1234 at 2012-12-06 21:16:09
可以这么理解,当然,不能单独只看一个参数来判别。对于k点的选择等,都需要考虑。...

嗯,对于我这个体系,当K点设置为3x3x3时跟5x5x5时,能量差别很小,在0.001eV一下了,所以K点就设为3x3x3了~多谢啦~
5楼2012-12-09 07:42:31
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lrjhxh

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
应该是指总能量的差值在0.001eV
6楼2013-05-03 10:48:21
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对马拉二胡

至尊木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主你好, 我想请问一下你的测试脚本是怎么写的?主要是参数的设置。
相互学习,共同进步。
7楼2014-03-15 09:04:51
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fdd096030079

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 对马拉二胡 at 2014-03-15 09:04:51
楼主你好, 我想请问一下你的测试脚本是怎么写的?主要是参数的设置。

仅供参考哦:
#PBS -N bulk-encut
#PBS -j oe
#PBS -l nodes=1:ppn=16
#PBS -l walltime=120:00:00
#PBS -q low

cd $PBS_O_WORKDIR
NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`

for en in 300 350 400 450 500 550 600 ;do
        cat > INCAR <<!
Startparameter for this run:
#   PREC   = normal    normal or accurate (medium, high low for compatibility)
   NPAR = 4
   ISTART =      0    job   : 0-new  1-cont  2-samecut
   ICHARG =      2    charge: 1-file 2-atom 10-const
#   ISPIN  =      1    spin polarized calculation?
#   NGX = 26
#   NGY = 26
#   NGZ = 102
#   NBANDS = 150
Electronic Relaxation 1
   ENCUT  =  $en eV  
   NELM   =     60;   NELMIN=  2; NELMDL=-12     # of ELM steps
   EDIFF  = 0.1E-04   stopping-criterion for ELM
#   LREAL  =      F    real-space projection
Ionic relaxation
   EDIFFG = -.1E-01   stopping-criterion for IOM
   NSW    =      0    number of steps for IOM
   IBRION =      -1    ionic relax: 0-MD 1-quasi-New 2-CG
#   ISIF   =      3    stress and relaxation
#   ISYM   =      2    0-nonsym 1-usesym 2-fastsym
#   POTIM  = 0.5000    time-step for ionic-motion
DOS related values:
#   EMIN   =  10.00;   EMAX   =-10.00  energy-range for DOS
   ISMEAR =     0;  
#   SIGMA  =   0.20  broadening in eV -4-tet -1-fermi 0-gaus
Electronic relaxation 2 (details)
   IALGO  =     48    algorithm
Write flags
   LWAVE  =      F    write WAVECAR
   LCHARG =      F    write CHGCAR
!

~/bin/mpirun -np $NP  ~/bin/vasp > vasp.out

cp CONTCAR POSCAR

E=`tail -1 OSZICAR | awk '{printf "%12.6f \n", $5}'`

echo $en $E >> en.dat

done
8楼2014-11-13 09:25:28
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微6凉

铁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by fdd096030079 at 2014-11-13 09:25:28
仅供参考哦:
#PBS -N bulk-encut
#PBS -j oe
#PBS -l nodes=1:ppn=16
#PBS -l walltime=120:00:00
#PBS -q low

cd $PBS_O_WORKDIR
NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`

for en in 300 350 400 450 500 550  ...

您好,请问一下,您这个脚本是如何运行的呢?是把它和四个文件放一起运行它,还是需要一个服务器需要运行的脚本然后运行服务器需要的脚本呢?
9楼2015-08-03 10:40:00
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