24小时热门版块排行榜    

查看: 4392  |  回复: 6

huangpu2009

铁虫 (小有名气)

[交流] Vasp用PBS提交的批处理脚本~~~~~ 已有5人参与

小弟想写一个PBS提交VASP的的批处理脚本,流程是
1、几何优化
2、静态计算
3、计算DOS
4、计算BAND
提交一个PBS,依次进行上面的计算,就不用那么麻烦的来回提交了。

请问有懂的吗?求教一下,谢谢了。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ApolloYang

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个不难
晶体优化单独做
建立两个文件夹 makedir DOS  做好INCAR POSCAR POTCAR KPOINTS
   makedir band 建好INCAR 和KPOINTS

脚本
  #!/bin/sh
  cd ~/DOS
  mpirun -np "n"  vasp
  cp WAVECAR CHGCAR ~/band/.
  cd ~/band
  mpirun -np "n"  vasp
  done


根据自己的情况做
2楼2012-12-08 22:02:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanarsenal

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这么懒……自己写一个不就得了,这样的东西都求……
3楼2012-12-08 23:52:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dengyiqun

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by ApolloYang at 2012-12-08 22:02:45
这个不难
晶体优化单独做
建立两个文件夹 makedir DOS  做好INCAR POSCAR POTCAR KPOINTS
   makedir band 建好INCAR 和KPOINTS

脚本
  #!/bin/sh
  cd ~/DOS
  mpirun -np "n"  vasp
  cp  ...

多谢楼主的解答啊,真的不是懒,而是不知道怎么去做,自己一人慢慢摸索,很难啊
4楼2012-12-09 09:05:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangpu2009

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ApolloYang at 2012-12-08 22:02:45
这个不难
晶体优化单独做
建立两个文件夹 makedir DOS  做好INCAR POSCAR POTCAR KPOINTS
   makedir band 建好INCAR 和KPOINTS

脚本
  #!/bin/sh
  cd ~/DOS
  mpirun -np "n"  vasp
  cp  ...

谢谢,我试一下。
5楼2012-12-09 15:34:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
6楼2015-03-06 15:23:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

春华秋实2020

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个帖子很久没更新,我自己根据这个帖子做了一下修改。可以运行,大家可以试一下。需要说明,nscf是计算非自洽,要建立咋scf文件夹下,脚本中文件目录不能写成~/scf,会去根目录下找,直接写文件夹scf。另外,也不需要done
#!/bin/bash
cd scf
mpirun -np 8 /vasp  (自己电脑上的命令)
cp WAVECAR CHGCAR nscf
cd nscf
mpriun -np 8 /vasp

不是专业人员,只是比着葫芦画瓢,做的
7楼2018-11-29 11:29:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 huangpu2009 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 5/250 2026-09-16 21:39 by MHf40yA0Uhyb
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 8/400 2026-09-16 18:37 by rRvxEj3zorCy
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 6/300 2026-09-16 17:27 by i3KBRD19ERkG
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-16 17:12 by i3KBRD19ERkG
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-16 17:03 by i3KBRD19ERkG
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-16 17:00 by i3KBRD19ERkG
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-16 16:15 by i3KBRD19ERkG
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-16 14:36 by i3KBRD19ERkG
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 3/150 2026-09-16 08:27 by SjQobnC04j06
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 4/200 2026-09-16 06:36 by LH5NkK5Ud4bh
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-16 05:15 by LH5NkK5Ud4bh
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 7/350 2026-09-16 03:26 by DgNGHc3h5tPl
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-16 02:50 by DgNGHc3h5tPl
[考博] 申博发邮件 +4 Lmengk 2026-09-15 4/200 2026-09-16 00:05 by 木心想继续深造
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-15 20:26 by zNcEhTcH7ihq
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 0pYnUiPDfdnk 2026-09-14 3/150 2026-09-15 19:35 by CgyNCDVNhGVg
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-15 16:39 by CgyNCDVNhGVg
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-15 15:14 by CgyNCDVNhGVg
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-15 14:58 by CgyNCDVNhGVg
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
信息提示
请填处理意见