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huangpu2009

铁虫 (小有名气)

[交流] Vasp用PBS提交的批处理脚本~~~~~ 已有5人参与

小弟想写一个PBS提交VASP的的批处理脚本,流程是
1、几何优化
2、静态计算
3、计算DOS
4、计算BAND
提交一个PBS,依次进行上面的计算,就不用那么麻烦的来回提交了。

请问有懂的吗?求教一下,谢谢了。
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ApolloYang

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个不难
晶体优化单独做
建立两个文件夹 makedir DOS  做好INCAR POSCAR POTCAR KPOINTS
   makedir band 建好INCAR 和KPOINTS

脚本
  #!/bin/sh
  cd ~/DOS
  mpirun -np "n"  vasp
  cp WAVECAR CHGCAR ~/band/.
  cd ~/band
  mpirun -np "n"  vasp
  done


根据自己的情况做
2楼2012-12-08 22:02:45
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fanarsenal

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这么懒……自己写一个不就得了,这样的东西都求……
3楼2012-12-08 23:52:51
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dengyiqun

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by ApolloYang at 2012-12-08 22:02:45
这个不难
晶体优化单独做
建立两个文件夹 makedir DOS  做好INCAR POSCAR POTCAR KPOINTS
   makedir band 建好INCAR 和KPOINTS

脚本
  #!/bin/sh
  cd ~/DOS
  mpirun -np "n"  vasp
  cp  ...

多谢楼主的解答啊,真的不是懒,而是不知道怎么去做,自己一人慢慢摸索,很难啊
4楼2012-12-09 09:05:44
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huangpu2009

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ApolloYang at 2012-12-08 22:02:45
这个不难
晶体优化单独做
建立两个文件夹 makedir DOS  做好INCAR POSCAR POTCAR KPOINTS
   makedir band 建好INCAR 和KPOINTS

脚本
  #!/bin/sh
  cd ~/DOS
  mpirun -np "n"  vasp
  cp  ...

谢谢,我试一下。
5楼2012-12-09 15:34:59
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6楼2015-03-06 15:23:18
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春华秋实2020

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个帖子很久没更新,我自己根据这个帖子做了一下修改。可以运行,大家可以试一下。需要说明,nscf是计算非自洽,要建立咋scf文件夹下,脚本中文件目录不能写成~/scf,会去根目录下找,直接写文件夹scf。另外,也不需要done
#!/bin/bash
cd scf
mpirun -np 8 /vasp  (自己电脑上的命令)
cp WAVECAR CHGCAR nscf
cd nscf
mpriun -np 8 /vasp

不是专业人员,只是比着葫芦画瓢,做的
7楼2018-11-29 11:29:43
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