24小时热门版块排行榜    

查看: 4325  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

huangpu2009

铁虫 (小有名气)

[交流] Vasp用PBS提交的批处理脚本~~~~~ 已有5人参与

小弟想写一个PBS提交VASP的的批处理脚本,流程是
1、几何优化
2、静态计算
3、计算DOS
4、计算BAND
提交一个PBS,依次进行上面的计算,就不用那么麻烦的来回提交了。

请问有懂的吗?求教一下,谢谢了。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

春华秋实2020

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个帖子很久没更新,我自己根据这个帖子做了一下修改。可以运行,大家可以试一下。需要说明,nscf是计算非自洽,要建立咋scf文件夹下,脚本中文件目录不能写成~/scf,会去根目录下找,直接写文件夹scf。另外,也不需要done
#!/bin/bash
cd scf
mpirun -np 8 /vasp  (自己电脑上的命令)
cp WAVECAR CHGCAR nscf
cd nscf
mpriun -np 8 /vasp

不是专业人员,只是比着葫芦画瓢,做的
7楼2018-11-29 11:29:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

ApolloYang

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个不难
晶体优化单独做
建立两个文件夹 makedir DOS  做好INCAR POSCAR POTCAR KPOINTS
   makedir band 建好INCAR 和KPOINTS

脚本
  #!/bin/sh
  cd ~/DOS
  mpirun -np "n"  vasp
  cp WAVECAR CHGCAR ~/band/.
  cd ~/band
  mpirun -np "n"  vasp
  done


根据自己的情况做
2楼2012-12-08 22:02:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanarsenal

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这么懒……自己写一个不就得了,这样的东西都求……
3楼2012-12-08 23:52:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dengyiqun

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by ApolloYang at 2012-12-08 22:02:45
这个不难
晶体优化单独做
建立两个文件夹 makedir DOS  做好INCAR POSCAR POTCAR KPOINTS
   makedir band 建好INCAR 和KPOINTS

脚本
  #!/bin/sh
  cd ~/DOS
  mpirun -np "n"  vasp
  cp  ...

多谢楼主的解答啊,真的不是懒,而是不知道怎么去做,自己一人慢慢摸索,很难啊
4楼2012-12-09 09:05:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-28 13:44 by winsaint
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +4 gdd2018 2026-08-28 5/250 2026-08-28 12:41 by Tide man
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见