| 查看: 3938 | 回复: 8 | ||
po390金虫 (小有名气)
|
[求助]
VMD与lammpstrj文件 已有2人参与
|
我VMD导入用LAMMPS生成的lammpstrj文件时，分子之间的成建情况十分混乱（如下图），请教各位有什么好的解决方法吗？ BV83]C2M}C_PC(]T8T5S$@P.png |
回复此楼» 猜你喜欢
323求调剂
已经有6人回复
-
一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂
已经有4人回复
-
352求调剂
已经有3人回复
-
一志愿东华大学化学070300，求调剂
已经有8人回复
-
277材料科学与工程080500求调剂
已经有7人回复
-
317求调剂
已经有18人回复
-
293求调剂
已经有5人回复
-
280分求调剂 一志愿085802
已经有7人回复
-
0854电子信息求调剂
已经有3人回复
-
263求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 运行之后水分子怎么乱了,氢氧键跑老远,上图,上in data文件
已经有12人回复
- Ubuntu下安装lammps单机版（no MPI，no FFT）几点心得
已经有5人回复
- 关于VMD批量导入的问题
已经有13人回复
- LAMMPS的轨迹文件怎么转换为VMD的PDB文件
已经有7人回复
- 【求助】关于LAMMPS建模
已经有9人回复
- 经过MS模型导入到LAMMPS，在运算时出现的错误求助
已经有22人回复
- dump出文件显示问题
已经有16人回复
- lammps文件可视化问题
已经有14人回复
- 求助一段批量处理文件的shell脚本
已经有4人回复
- 关于VMD可视化的问题
已经有5人回复
赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 73 (初中生)
- 金币: 6197.9
- 散金: 141
- 红花: 33
- 帖子: 1541
- 在线: 700小时
- 虫号: 1544094
- 注册: 2011-12-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
2楼2015-07-24 09:23:26
3楼2015-07-24 22:51:15
po390
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1411.5
- 散金: 20
- 帖子: 106
- 在线: 75.2小时
- 虫号: 1442167
- 注册: 2011-10-14
- 专业: 理论和计算化学
我知道在将原子显示调成VDW之后，分子键的显示就不会混乱。但我想解决的是，如何在line的模式下分子键不会显示混乱，更确切的说是读取lammps轨迹文件时可以读取到轨迹文件的分子成建信息和拓扑结构信息，是否需要加载类似psf的文件？ 4楼2015-09-28 15:52:59
haiyuntianya
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 191.6
- 散金: 75
- 帖子: 167
- 在线: 102.1小时
- 虫号: 2105851
- 注册: 2012-11-04
- 性别: GG
- 专业: 粘合剂
5楼2015-10-03 19:08:24
po390
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1411.5
- 散金: 20
- 帖子: 106
- 在线: 75.2小时
- 虫号: 1442167
- 注册: 2011-10-14
- 专业: 理论和计算化学
6楼2015-10-21 21:05:50
alundilong
木虫 (正式写手)
- 应助: 129 (高中生)
- 金币: 2019.1
- 红花: 18
- 帖子: 309
- 在线: 56小时
- 虫号: 595468
- 注册: 2008-09-08
- 性别: GG
- 专业: 传热传质学
7楼2015-10-21 22:30:14
记忆的拾荒者
新虫 (初入文坛)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 14.2
- 帖子: 28
- 在线: 11.1小时
- 虫号: 2944933
- 注册: 2014-01-23
- 性别: GG
- 专业: 化工热力学和基础数据
8楼2016-10-17 19:42:50
guozhijing
银虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 254.1
- 帖子: 44
- 在线: 36.8小时
- 虫号: 4435776
- 注册: 2016-02-25
- 性别: MM
- 专业: 高分子材料结构与性能
9楼2016-10-19 11:15:31
