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po390金虫 (小有名气)
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VMD与lammpstrj文件已有2人参与
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我VMD导入用LAMMPS生成的lammpstrj文件时，分子之间的成建情况十分混乱（如下图），请教各位有什么好的解决方法吗？ BV83]C2M}C_PC(]T8T5S$@P.png |
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3楼2015-07-24 22:51:15
赵红霞
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2楼2015-07-24 09:23:26
po390
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我知道在将原子显示调成VDW之后，分子键的显示就不会混乱。但我想解决的是，如何在line的模式下分子键不会显示混乱，更确切的说是读取lammps轨迹文件时可以读取到轨迹文件的分子成建信息和拓扑结构信息，是否需要加载类似psf的文件？4楼2015-09-28 15:52:59
haiyuntianya
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5楼2015-10-03 19:08:24