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1楼2015-05-12 15:39:23

guozhijing

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8楼: Originally posted by 记忆的拾荒者 at 2016-10-17 19:42:50
想问一下如果是用ms建完模型后怎么用vmd 观察呢

保存为pdb格式就可以

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人生最精彩的不是实现梦想的瞬间，而是坚持梦想的过程

9楼2016-10-19 11:15:31

查看全部 9 个回答

赵红霞

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楼主的问题解决了没有呢？我也遇到同样的问题了

2楼2015-07-24 09:23:26

feeather

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【答案】应助回帖

引用回帖:

2楼: Originally posted by 赵红霞 at 2015-07-24 09:23:26
楼主的问题解决了没有呢？我也遇到同样的问题了

简单看一下vmd的手册吧。在graphics→representations下具体调整。

[ 发自小木虫客户端 ]

3楼2015-07-24 22:51:15

po390

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专业: 理论和计算化学

引用回帖:

3楼: Originally posted by feeather at 2015-07-24 22:51:15
简单看一下vmd的手册吧。在graphics→representations下具体调整。
...

感谢你的回复，回复的有点晚，不好意思！

我知道在将原子显示调成VDW之后，分子键的显示就不会混乱。但我想解决的是，如何在line的模式下分子键不会显示混乱，更确切的说是读取lammps轨迹文件时可以读取到轨迹文件的分子成建信息和拓扑结构信息，是否需要加载类似psf的文件？

4楼2015-09-28 15:52:59