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duyang1217铁虫 (小有名气)
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转录组测序正常分析会得到大量的差异基因的进一步分析 已有8人参与
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| 转录组测序正常分析会得到大量的差异基因，之后大家都不知道如何进行下面的试验，不知所从，我现在在此基础上继续阅读大量文献分析得到更少的候选基因，有没有意义？能发文章吗？大家有什么看法，可以发表下意见。 |
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duyang1217
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你要先问问自己当初为什么做这个分析。是因为方法学比较时髦、大家都在做？还是自己想解决某个具体问题，需要做这一分析。如果是前者，大概就会落到目前的状态：下一步该怎么做、甚至如何分析、利用所得到的结果都不知道怎么做了。 任何两种条件下都会有许多差异表达的基因，这是毫无疑问的。所以单纯找出一大把的差异基因不能说没有意义，而只能说是这是问题的开始而不是结束。所以单凭这些结果不能说发不了文章，但肯定发不了好的文章，因为这只是故事的开始。 你可以通过各种分析、统计手段表面这些差异基因是真的差异。但必需有个validation的过程，当然显然不需要所有的都去验证，但至少有验证若干有代表性的基因，而且尽可能在mRNA和蛋白水平上进行验证。具体选择哪些基因，则取决于你开始做这个分析的初衷，或者说你要解决的主要问题。当然验证完毕后还需要后续各种工作的继续和深入，如差异基因的表达调控、生物学功能的检测和相关机制、siganling pathway的分析等等，才算得上一篇完整的论文。 |
5楼2015-04-01 10:22:46
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