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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » VMD怎么读取data文件？
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对天空说lrj

金虫 (正式写手)

[求助] VMD怎么读取data文件？ 已有5人参与

为了验证自己写的data文件对不对，我想用VMD导入data文件看看，但是不晓得怎么读取？求指点
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我若盛开，蝴蝶自来
1楼 2015-03-25 10:12:16
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zzqzzq2007

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 对天空说lrj at 2015-03-25 20:51:43
我也是用lammps里面的msi2lmp导出来的，类型选择lammps trajectory也不对呢？文件名*.data不用改吧？麻烦问一下还有什么注意事项吗？我不知道是不是自己哪里做的不对？...

额，我是用dump导出来的，导出来的好像是dump.***，这个文件用lammps trajectory没有问题。。。
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每个优秀的人，都有一段沉默的时光。那一段时光，是付出了很多努力，忍受孤独和寂寞，不抱怨不诉苦，日后说起时，连自己都能被感动的日子。
9楼2015-03-25 21:20:37
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
https://sites.google.com/site/akohlmey/software/topotools
看里面的例子。

topo readlammpsdata *.data
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2楼2015-03-25 10:53:10
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WanderingHeart

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2015-03-25 03:53:10
https://sites.google.com/site/akohlmey/software/topotools
看里面的例子。

topo readlammpsdata *.data

google sites访问不了啊~
赞一下 回复此楼
3楼2015-03-25 11:37:06
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对天空说lrj

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2015-03-25 10:53:10
https://sites.google.com/site/akohlmey/software/topotools
看里面的例子。

topo readlammpsdata *.data

链接打不开，想问直接在VMD里面输入这个命令并不好用提示打不开，输入这个命令之前是否先导入你什么的？或者要操作一些什么呢？
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我若盛开，蝴蝶自来
4楼2015-03-25 13:20:11
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