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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 一个细菌的基因组草图可与另一株菌的全基因组比较相似性吗？
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贤愚Libra

银虫 (正式写手)

[交流] 一个细菌的基因组草图可与另一株菌的全基因组比较相似性吗？

一个细菌的基因组草图（draft genome sequence）如何与另一株细菌的全基因组（whole genome sequence）比较相似性？
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www------sr-------------
1楼 2015-03-11 20:19:38
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阿Q~~

至尊木虫 (文坛精英)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
路过的看了一下，帮顶，新春快乐！~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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自强不息，厚德载物；独立精神，自由思想。
6楼2015-03-13 11:20:25
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nanhu1984

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
MUAVE （http://asap.genetics.wisc.edu/software/mauve/）
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https://www.microbialgenomic.cn/
3楼2015-03-12 14:57:47
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贤愚Libra

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by nanhu1984 at 2015-03-12 14:57:47
MUAVE （http://asap.genetics.wisc.edu/software/mauve/）

一株菌的基因草图序列与一株菌的全基因组序列如何比较相似性？，基因草图含有100条序列。（PS：不是一条一条的分别比对）
赞一下 回复此楼
www------sr-------------
4楼2015-03-13 10:22:56
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王丹2013

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
贤愚Libra(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-03-13 23:48:19
可以先直接做个核苷酸相似度（ANI)分析，再用CGview Comparison Tool软件画一个两个基因组的比较图，还可以用MCL软件分析这两个基因组的共有基因和特异基因
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2015-03-13 11:13:51
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