24小时热门版块排行榜    

查看: 3777  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhangmao511

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助,请问有预测ORF的软件吗??谢谢! 已有2人参与

请教各位大虾,请问有预测ORF的软件吗,需要是windows版本的,而且是可以下载到本地的(不是那种网页版的,我知道NCBI有ORF FINDER,但是在线的,无法下载)??在GOOGLE上翻了好久都没找,在这里请教大家了,希望能给点提示(只要说出名字,我自己在网上搜下,但是希望真的能下载下来),谢谢!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmao511

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by daniel1112 at 2015-02-26 05:25:13
geneious,vector nti等生物信息学分析软件都行

十分感谢你的回答,我看了一下geneious,vector nti,这2个软件貌似是一个比较大的客户端界面式软件,ORF FIND只是这个软件中其中的一个功能。也怪我一开始没表述清楚,我是想找一个命令行式的ORF FIND的软件(主要就是)。因为我自己在做一个WORKFLOW的软件,想把预测ORF的功能植入进去,所以想找一个现成软件植入进去。而命令行式的程序(GeneMark不知道你听说过没,类似JAR包的,或者XXX.exe后面跟参数的)比较容易植入,而界面版的大软件很难嵌入,我也只需要一个预测ORF的功能。其实LINUX或者WINDOWS版也无所谓了,不知道有什么推荐吗??谢谢
4楼2015-02-26 11:11:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

jiqinger

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhangmao511(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-02-26 22:38:45
bioxm,本软件用于DNA序列资料的常规分析,包括ORF查找, 序列格式化, 翻译, 蛋白质分子量和等电点的计算, 限制酶酶切位点分析,引物辅助设计等,另外还提供了序列格式文件的批量转换工具,引物浓度计算工具,酶切位点查询工具,自动去载体序列工具,
123456
2楼2015-02-25 18:08:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmao511

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiqinger at 2015-02-25 18:08:38
bioxm,本软件用于DNA序列资料的常规分析,包括ORF查找, 序列格式化, 翻译, 蛋白质分子量和等电点的计算, 限制酶酶切位点分析,引物辅助设计等,另外还提供了序列格式文件的批量转换工具,引物浓度计算工具,酶切位点查询 ...

十分感谢你的回答,我看了一下bioxm,这个软件貌似是一个比较大的客户端界面式软件,ORF FIND只是这个软件中其中的一个功能。也怪我一开始没表述清楚,我是想找一个命令行式的ORF FIND的软件(主要就是)。因为我自己在做一个WORKFLOW的软件,想把预测ORF的功能植入进去,所以想找一个现成软件植入进去。而命令行式的程序(GeneMark不知道你听说过没,类似JAR包的,或者XXX.exe后面跟参数的)比较容易植入,而界面版的大软件很难嵌入,我也只需要一个预测ORF的功能。其实LINUX或者WINDOWS版也无所谓了,不知道有什么推荐吗??谢谢
5楼2015-02-26 11:12:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiqinger

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangmao511 at 2015-02-26 11:12:15
十分感谢你的回答,我看了一下bioxm,这个软件貌似是一个比较大的客户端界面式软件,ORF FIND只是这个软件中其中的一个功能。也怪我一开始没表述清楚,我是想找一个命令行式的ORF FIND的软件(主要就是)。因为我自 ...

那你找一个在线的预测ORF的软件,比如:ORF Finder,你查找他的源代码,从源代码中可以查到。
123456
6楼2015-02-26 18:33:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:22 by oEVWOejN9taj
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:19 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 17:02 by oEVWOejN9taj
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:47 by oEVWOejN9taj
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:27 by oEVWOejN9taj
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:02 by oEVWOejN9taj
[基金申请] fileCode有新解读? +9 Tide man 2026-08-08 17/850 2026-08-08 14:56 by archvillain
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +5 布布和一二 2026-08-08 8/400 2026-08-08 14:54 by archvillain
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:39 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:22 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +11 且听虎啸 2026-08-07 14/700 2026-08-08 12:50 by 布布和一二
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
信息提示
请填处理意见