| 查看: 2358 | 回复: 10 | |||
mengbiotech金虫 (小有名气)
|
[求助]
宏基因组的ORF预测 已有1人参与
|
|
大家好，我是做宏基因组的。现在在ORF预测上比较纠结。 因为看到很多文献的方法是不一样的。 有的用NCBI 的ORF Finder，这个得到的ORF最多； 有的用MetaGeneMark for MetaGenome Gene Finding，这个比较少，35 kb的能预测到25个左右，SCIENCE有篇文章是用这个；还有篇NATURE用的是SoftBerry，没试过。 有没有同学了解的？他们之间是存在误差的，但是具体哪个好，估计也很难说出来。 大家说说自己的经验吧 谢谢！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 精彩 |
» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有86人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 变性梯度凝胶电泳、焦磷酸测序、宏基因组测序有什么区别啊？
已经有4人回复
- 宏基因组与16SrDNA这两种研究方法的区别
已经有6人回复
- 请教：16S RDNA克隆文库与宏基因组测序的区别？
已经有5人回复
- 【求助】用cDNA的ORF序列以基因组DNA为模板 做PCR 为何P不出其对应的基因组序列?
已经有8人回复
- 对宏基因组感兴趣的出来交流交流
已经有35人回复
- 宏基因组学技术在识别复杂环境样品中微生物的结构组成及功能中的应用
已经有5人回复
- 【资料】宏基因组Fosmid 文库构建
已经有84人回复
- 宏基因组末端随机测序研究环境微生物多样性基本原理？
已经有7人回复
shinesnail
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1191.1
- 帖子: 92
- 在线: 82.1小时
- 虫号: 2254551
- 注册: 2013-01-22
- 性别: GG
- 专业: 生物化工与食品化工
2楼2013-05-13 22:14:44
mengbiotech
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 416.3
- 散金: 2284
- 红花: 6
- 帖子: 141
- 在线: 217小时
- 虫号: 1524465
- 注册: 2011-12-05
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
3楼2013-05-14 08:58:36
mengbiotech
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 416.3
- 散金: 2284
- 红花: 6
- 帖子: 141
- 在线: 217小时
- 虫号: 1524465
- 注册: 2011-12-05
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
4楼2013-05-14 08:58:51
shinesnail
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1191.1
- 帖子: 92
- 在线: 82.1小时
- 虫号: 2254551
- 注册: 2013-01-22
- 性别: GG
- 专业: 生物化工与食品化工
5楼2013-05-14 10:03:16
6楼2013-05-14 11:34:17
mengbiotech
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 416.3
- 散金: 2284
- 红花: 6
- 帖子: 141
- 在线: 217小时
- 虫号: 1524465
- 注册: 2011-12-05
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
7楼2013-05-14 11:47:48
hudazhangyi
银虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 460.5
- 红花: 8
- 帖子: 393
- 在线: 156.1小时
- 虫号: 1991482
- 注册: 2012-09-11
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
8楼2013-05-15 12:04:09
9楼2014-01-12 20:52:23
mengbiotech
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 416.3
- 散金: 2284
- 红花: 6
- 帖子: 141
- 在线: 217小时
- 虫号: 1524465
- 注册: 2011-12-05
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
10楼2014-01-13 08:49:50