| 查看: 2319 | 回复: 10 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
mengbiotech金虫 (小有名气)
|
[求助]
宏基因组的ORF预测已有1人参与
|
||
|
大家好，我是做宏基因组的。现在在ORF预测上比较纠结。 因为看到很多文献的方法是不一样的。 有的用NCBI 的ORF Finder，这个得到的ORF最多； 有的用MetaGeneMark for MetaGenome Gene Finding，这个比较少，35 kb的能预测到25个左右，SCIENCE有篇文章是用这个；还有篇NATURE用的是SoftBerry，没试过。 有没有同学了解的？他们之间是存在误差的，但是具体哪个好，估计也很难说出来。 大家说说自己的经验吧 谢谢！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 精彩 |
» 猜你喜欢
为什么蛋白质氨基酸测定大家都测17种?
已经有5人回复
-
《灰分记：我与坩埚的“灰烬”之恋》
已经有3人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有207人回复
-
求助 食品检验工（基础知识），中国劳动社会出版社 电子版
已经有5人回复
-
胶体几丁质的结晶度？
已经有0人回复
-
诚挚招收全日制博士！！！中国农业科学院麻类研究所谭志坚研究员课题组招收博士
已经有2人回复
-
三甲基羟乙基丙二胺的合成路线
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
变性梯度凝胶电泳、焦磷酸测序、宏基因组测序有什么区别啊？
已经有4人回复- 宏基因组与16SrDNA这两种研究方法的区别
已经有6人回复
- 请教：16S RDNA克隆文库与宏基因组测序的区别？
已经有5人回复
- 【求助】用cDNA的ORF序列以基因组DNA为模板 做PCR 为何P不出其对应的基因组序列?
已经有8人回复
- 对宏基因组感兴趣的出来交流交流
已经有35人回复
- 宏基因组学技术在识别复杂环境样品中微生物的结构组成及功能中的应用
已经有5人回复
- 【资料】宏基因组Fosmid 文库构建
已经有84人回复
- 宏基因组末端随机测序研究环境微生物多样性基本原理？
已经有7人回复
hudazhangyi
银虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 460.5
- 红花: 8
- 帖子: 393
- 在线: 156.1小时
- 虫号: 1991482
- 注册: 2012-09-11
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
8楼2013-05-15 12:04:09
shinesnail
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1191.1
- 帖子: 92
- 在线: 82.1小时
- 虫号: 2254551
- 注册: 2013-01-22
- 性别: GG
- 专业: 生物化工与食品化工
2楼2013-05-13 22:14:44
mengbiotech
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 416.3
- 散金: 2284
- 红花: 6
- 帖子: 141
- 在线: 217小时
- 虫号: 1524465
- 注册: 2011-12-05
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
3楼2013-05-14 08:58:36
mengbiotech
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 416.3
- 散金: 2284
- 红花: 6
- 帖子: 141
- 在线: 217小时
- 虫号: 1524465
- 注册: 2011-12-05
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
4楼2013-05-14 08:58:51