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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 宏基因组与16SrDNA这两种研究方法的区别
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WB

金虫 (小有名气)

[求助] 宏基因组与16SrDNA这两种研究方法的区别

不好意思，刚处于查资料阶段，以前这方面的知识就很薄弱，有什么不对的地方请大家多多批评指正。看了目前对发酵食品中菌群研究主要有宏基因组和16SrRNA这两种方法，但是具体这两种方法的研究目的有什么区别，我就非常的晕，貌似看见有个帖子里说16SrRNA是做鉴定用的，那宏基因组不是也能做鉴定吗？
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1楼 2012-12-14 18:14:23
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WB

金虫 (小有名气)
都木有人理我咩~~~~泪
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2楼2012-12-14 19:12:43
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连林旺

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
WB: 金币+5, ★★★很有帮助, 很有帮助，谢谢您！ 2012-12-15 20:03:00
细菌的16s rRNA具有高度的保守性和特异性，因此16s rRNA基因检测技术已成为病原菌检测和鉴定的一种强有力工具，该技术主要有三个步骤：首先是基因组DNA的获得，其次是16s rRNA基因片段的获得，最后是进行16s rRNA基因序列的分析。而宏基因组指生境中全部微小生物遗传物质的总和。所以我觉得二者是一个相辅相成的过程，结合起来研究结果会更精细。
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3楼2012-12-15 19:23:50
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WB

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 连林旺 at 2012-12-15 19:23:50
细菌的16s rRNA具有高度的保守性和特异性，因此16s rRNA基因检测技术已成为病原菌检测和鉴定的一种强有力工具，该技术主要有三个步骤：首先是基因组DNA的获得，其次是16s rRNA基因片段的获得，最后是进行16s rRNA基 ...

谢谢您的帮助，另想问一下是否这样认为，研究细菌这类原核生物的菌群分类即可以通过对其16SrRNA进行研究判断，但是样品中若还有其他类似霉菌、酵母菌之类的菌群时，由于这类真核微生物不能用16SrRNA进行研究，所以也可以通过宏基因组分析来对其进行菌群分类研究？
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4楼2012-12-15 20:13:46
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连林旺

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by WB at 2012-12-15 20:13:46
谢谢您的帮助，另想问一下是否这样认为，研究细菌这类原核生物的菌群分类即可以通过对其16SrRNA进行研究判断，但是样品中若还有其他类似霉菌、酵母菌之类的菌群时，由于这类真核微生物不能用16SrRNA进行研究，所以 ...

可以这样认为，一般在培养菌群的时候避免受到污染，提取16sRNA的时候也要技术娴熟点问题就不大。
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5楼2012-12-16 09:56:30
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快乐酒僧

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by WB at 2012-12-15 20:13:46
谢谢您的帮助，另想问一下是否这样认为，研究细菌这类原核生物的菌群分类即可以通过对其16SrRNA进行研究判断，但是样品中若还有其他类似霉菌、酵母菌之类的菌群时，由于这类真核微生物不能用16SrRNA进行研究，所以 ...

稍稍补充：研究其他的真菌类 可选用18SrRNA  ITS  原理方法类同。宏基新组 听着名字就比较霸气 适合于复杂菌群分析 后续通常是高通量测序，花费不菲呵！
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

WB
6楼2013-04-07 23:45:36
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WB

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 快乐酒僧 at 2013-04-07 23:45:36
稍稍补充：研究其他的真菌类 可选用18SrRNA  ITS  原理方法类同。宏基新组 听着名字就比较霸气 适合于复杂菌群分析 后续通常是高通量测序，花费不菲呵！...

好的好的，谢谢补充，非常更感谢哈
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7楼2013-04-08 20:28:14
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