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WB

金虫 (小有名气)

[求助] 宏基因组与16SrDNA这两种研究方法的区别

不好意思,刚处于查资料阶段,以前这方面的知识就很薄弱,有什么不对的地方请大家多多批评指正。看了目前对发酵食品中菌群研究主要有宏基因组和16SrRNA这两种方法,但是具体这两种方法的研究目的有什么区别,我就非常的晕,貌似看见有个帖子里说16SrRNA是做鉴定用的,那宏基因组不是也能做鉴定吗?
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快乐酒僧

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by WB at 2012-12-15 20:13:46
谢谢您的帮助,另想问一下是否这样认为,研究细菌这类原核生物的菌群分类即可以通过对其16SrRNA进行研究判断,但是样品中若还有其他类似霉菌、酵母菌之类的菌群时,由于这类真核微生物不能用16SrRNA进行研究,所以 ...

稍稍补充:研究其他的真菌类 可选用18SrRNA  ITS  原理方法类同。宏基新组 听着名字就比较霸气 适合于复杂菌群分析 后续通常是高通量测序,花费不菲呵!

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WB
6楼2013-04-07 23:45:36
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WB

金虫 (小有名气)

都木有人理我咩~~~~泪
2楼2012-12-14 19:12:43
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连林旺

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
WB: 金币+5, ★★★很有帮助, 很有帮助,谢谢您! 2012-12-15 20:03:00
细菌的16s rRNA具有高度的保守性和特异性,因此16s rRNA基因检测技术已成为病原菌检测和鉴定的一种强有力工具,该技术主要有三个步骤:首先是基因组DNA的获得,其次是16s rRNA基因片段的获得,最后是进行16s rRNA基因序列的分析。而宏基因组指生境中全部微小生物遗传物质的总和。所以我觉得二者是一个相辅相成的过程,结合起来研究结果会更精细。
3楼2012-12-15 19:23:50
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WB

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 连林旺 at 2012-12-15 19:23:50
细菌的16s rRNA具有高度的保守性和特异性,因此16s rRNA基因检测技术已成为病原菌检测和鉴定的一种强有力工具,该技术主要有三个步骤:首先是基因组DNA的获得,其次是16s rRNA基因片段的获得,最后是进行16s rRNA基 ...

谢谢您的帮助,另想问一下是否这样认为,研究细菌这类原核生物的菌群分类即可以通过对其16SrRNA进行研究判断,但是样品中若还有其他类似霉菌、酵母菌之类的菌群时,由于这类真核微生物不能用16SrRNA进行研究,所以也可以通过宏基因组分析来对其进行菌群分类研究?
4楼2012-12-15 20:13:46
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