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mengbiotech金虫 (小有名气)
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宏基因组的ORF预测 已有1人参与
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大家好，我是做宏基因组的。现在在ORF预测上比较纠结。 因为看到很多文献的方法是不一样的。 有的用NCBI 的ORF Finder，这个得到的ORF最多； 有的用MetaGeneMark for MetaGenome Gene Finding，这个比较少，35 kb的能预测到25个左右，SCIENCE有篇文章是用这个；还有篇NATURE用的是SoftBerry，没试过。 有没有同学了解的？他们之间是存在误差的，但是具体哪个好，估计也很难说出来。 大家说说自己的经验吧 谢谢！ |
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