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铜虫 (初入文坛)

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[求助] 做完gromacs后怎么做分子表面静电势图？谢谢。已有2人参与

我知道可以通过gaussian得到chk文件来做分子表面静电势图，但不知道怎么得到chk文件？
我想知道通过VMD怎么做分子表面静电势图？
上面的2种方法任选一种告诉我具体的步骤，谢谢啊

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1楼 2015-02-09 20:45:54

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

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铜虫 (初入文坛)

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引用回帖:

6楼: Originally posted by fanc232 at 2015-02-10 13:24:51
.gro文件您拿文本编辑器打开一看就知道了，里面记录的是每个原子的三维坐标而已。我认为光凭这个是不能生成分子表面静电势图的。
至于.edr文件，如果您跑完md以后能找到它，要是没找到，那么就是mdrun这一步，没指 ...

谢谢啊

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