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Ivy尘

新虫 (正式写手)

[求助] 植物功能基因实验设计

最近要做单子叶药用植物的功能基因,刚入门,还有很多不了解的,在此求教。
1、想一次克隆多个基因,是以随机引物Oligo(dT)逆转录cDNA,之后各自进行扩增;还是分别设计接头引物结合Oligo(dT)以mRNA为模板进行3’,5‘端的RACE。逆转录Promega的M-MLV逆转录酶10,000 U报价188,是否要自己订购Oligo(dT)Primer和dNTP和RAnase,GoScript逆转录系统报价699,宝生最近主页上不去,逆转录酶报价没找到。。。
2、利用简并引物法设计引物(用Codehop设计的,不知道选择的引物适不适合),结合巢式PCR,得到一段较保守的的序列,直接连接T载体。宝生的pMD18-T,报价500,Promega的pGEM-T报价350,查说pMD18转化率高,不用做蓝白斑筛选,酶切之后可以作为pUC使用(?); pGEM-T据说效果也不错,不知道作为T载体使用之后能不能继续利用。
3、用RACE得到全长,查说3'端不需要试剂盒,5‘端比较困难。试剂盒用哪家的性价比高呢?
4、得到全长之后,验证蛋白(酶)的功能,只需要转到酵母中去表达吧,是要分泌蛋白还是不分泌呢,这关系到载体的选择,目前还不太了解。
5、考虑之后要不要做发状根诱导转化目的基因进行功能验证,但是单子叶的诱导一般认为比较困难,目前我所知道的只有玉米(据说也有鸭跖草科的植物成功过),我想试一试,问隔壁实验室要了发根农杆菌C58c1,打算参照玉米的诱导条件试试,也想用其他的发状根农杆菌菌种诱导,但是觉得购买菌种不合算,老师不会赞成的,所以最好可以低价从虫友那里买几种,若有不吝赠送的当然更加感激!(如果有虫友觉得单子叶植物的发状根诱导毫无可能,也可以有理有据地泼泼冷水,我看是不是就不做了,只在其他模式植物里进行功能验证。)
   
本人在南京,问题较多,希望有虫友站短联系~
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Ivy尘

新虫 (正式写手)

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2楼2014-12-16 09:57:00
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3楼2016-07-01 18:37:30
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