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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 有关单个氨基酸分子的pdb文件
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cyl001

新虫 (小有名气)

[求助] 有关单个氨基酸分子的pdb文件 已有1人参与

单个氨基酸分子的pdb文件怎么获取啊？？氨基酸分子在水里的形态是羧基上的两个氧原子的电荷分配的是一样的吗？羧基上的氢原子可以移到氨基上的氮原子上吗？还有如何模拟气体分子在水里的溶解度问题？
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1楼 2014-11-28 10:48:44
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
cyl001(abinitio代发): 金币+2, 鼓励交流 2014-12-02 08:02:09
1.用软件画出来，然后优化一下结构。
2.coo羧基氧的成键不一样电荷应该是不一样。3.可以。
4.跑动力学去模拟。

[ 发自小木虫客户端 ]
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2楼2014-12-02 06:38:05
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