版块导航: 正在加载中...

客户端APP下载

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

应助: 46 (小学生)
贵宾: 8.842
金币: 7440.4
散金: 9654
红花: 118
沙发: 23
帖子: 5306
在线: 1961.4小时
虫号: 537452
注册: 2008-04-01
性别: GG
专业: 理论和计算化学
管辖: 仿真模拟

[交流] 分子动力学轨迹文件一般多大？已有6人参与

跑分子动力学要跑动平衡，一直跑很多步来做统计。条查一下，各位做分子动力学的，包括经典和第一性原理的，有意义的结果的单个轨迹文件一般多大？

» 猜你喜欢

论文终于录用啦！满足毕业条件了已经有12人回复
2025年遐想已经有4人回复
投稿Elsevier的杂志（返修），总是在选择OA和subscription界面被踢皮球已经有8人回复
求个博导看看已经有18人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

Gromacs膜蛋白添加水模拟的一个问题已经有4人回复
分子动力学模拟轨迹文件格式的选择问题已经有4人回复
如何将amber的轨迹文件mdcrd格式转换成gromacs的轨迹文件格式 trr呢已经有5人回复
分子模拟中MSD的问题讨论已经有25人回复
LAMMPS的轨迹文件怎么转换为VMD的PDB文件已经有7人回复
跑完Gromacs的动力学模拟之后的轨迹文件.trr里面没有内容，为什么？已经有4人回复
vmd如何远程加载分子动力学轨迹？已经有9人回复
discover模拟，分子跑到盒子外面怎么办已经有5人回复
怎么把Discover动力学完成后的轨迹文件提取出来？已经有10人回复
轨迹文件mdcrd过大，VMD总是出错，有什么解决办法？已经有3人回复
【讨论】高斯和MS文件转换已经有12人回复
【求助】轨迹文件格式转化问题已经有3人回复

1楼 2014-11-26 00:19:12

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 73 (初中生)
金币: 6196.9
散金: 141
红花: 33
帖子: 1540
在线: 699.4小时
虫号: 1544094
注册: 2011-12-20
性别: MM
专业: 理论和计算化学

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
cenwanglai: 金币+3 2014-11-29 17:31:00

非常同意7楼的说法，光看输出轨迹文件的大小没有意义，首先是你模拟的具体体系的大小，其次是你设置的多少步输出一个构型，最后是稳定后的轨迹才具有统计意义

15楼2014-11-27 15:01:26

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

相关版块跳转我要订阅楼主 cenwanglai 的主题更新