应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 分子动力学的缺点
51/1返回列表
查看: 6085  |  回复: 14
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 2 个 模拟EPI ，点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

荷西树

新虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学的缺点已有1人参与

文章一篇分子动力学和实验结合的文章，审稿人纠结在为什么模拟温度跟实验温度不一致。想请大牛帮分析一下分子动力学的缺点或者给几篇文献作为佐证。谢谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学 分子模拟 Materials Studio 分子模拟
学学学

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2014-10-28 19:40:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by ChemiAndy at 2014-10-30 08:31:59
我猜 abinitio 的建议大概是这样的，在你所用的力场参数和模拟条件下，该体系的理论模拟熔沸点与实验熔沸点并不对应，因此模拟温度也不必严格与实验温度对应。这是一个很好的point。但是不足以说服审稿人，即你的温 ...

我的完整建议应该是这样的。
首先用构建固液二相平衡法计算此势函数的平衡熔点，如果此值与实验值相差无几，则可证明所使用的势函数对此问题的模拟是可靠的。
其次，强调md方式中周期性边界条件的性质，说明模拟的体系是一个没有任何缺陷，没有界面，没有表面的一个理想晶体，模拟的熔点是根据lindemann或born判据由于晶格失稳的结果，与实验中的实际晶体是存在一定的过热差的。金属所卢柯院士有篇关于铜过热的文章。
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2014-10-30 08:47:14
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
被问到这个问题是正常的，一般来说，模拟的体系是一个没有界面，没有缺陷的理想晶体，因此，会存在过热现象。另外，势函数也会影响模拟的熔点值。

可参考以下文献：

Zhang, S. L. et al. Phys. B Condens. Matter 406, 2637–2641 (2011).
L. Han, Q. An, R. Fu, L. Zheng, S. Luo.Phys. B: Condens. Matter, 405 (2010), p. 748
P. Buffat, J. Borel.Phys. Rev. A, 13 (1976), p. 2287
A. Kuksin, et al. Comput. Phys. Commun., 177 (2007), p. 34
赞一下 回复此楼
2楼2014-10-29 08:19:55
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

荷西树

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2014-10-29 08:19:55
被问到这个问题是正常的，一般来说，模拟的体系是一个没有界面，没有缺陷的理想晶体，因此，会存在过热现象。另外，势函数也会影响模拟的熔点值。

可参考以下文献：

Zhang, S. L. et al. Phys. B Condens. Ma ...

谢谢您
回复此楼
3楼2014-10-29 12:05:22
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 荷西树 at 2014-10-29 12:05:22
谢谢您...

不客气。建议你用文献中的固液平衡法获得一个接近实验熔点的结果，这样就可以解释审稿人的问题。
赞一下 回复此楼
4楼2014-10-29 14:31:19
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭