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荷西树

新虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学的缺点 已有1人参与

文章一篇分子动力学和实验结合的文章，审稿人纠结在为什么模拟温度跟实验温度不一致。想请大牛帮分析一下分子动力学的缺点或者给几篇文献作为佐证。谢谢
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1楼 2014-10-28 19:40:36
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by ChemiAndy at 2014-10-30 08:31:59
我猜 abinitio 的建议大概是这样的，在你所用的力场参数和模拟条件下，该体系的理论模拟熔沸点与实验熔沸点并不对应，因此模拟温度也不必严格与实验温度对应。这是一个很好的point。但是不足以说服审稿人，即你的温 ...

我的完整建议应该是这样的。
首先用构建固液二相平衡法计算此势函数的平衡熔点，如果此值与实验值相差无几，则可证明所使用的势函数对此问题的模拟是可靠的。
其次，强调md方式中周期性边界条件的性质，说明模拟的体系是一个没有任何缺陷，没有界面，没有表面的一个理想晶体，模拟的熔点是根据lindemann或born判据由于晶格失稳的结果，与实验中的实际晶体是存在一定的过热差的。金属所卢柯院士有篇关于铜过热的文章。
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8楼2014-10-30 08:47:14
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
被问到这个问题是正常的，一般来说，模拟的体系是一个没有界面，没有缺陷的理想晶体，因此，会存在过热现象。另外，势函数也会影响模拟的熔点值。

可参考以下文献：

Zhang, S. L. et al. Phys. B Condens. Matter 406, 2637–2641 (2011).
L. Han, Q. An, R. Fu, L. Zheng, S. Luo.Phys. B: Condens. Matter, 405 (2010), p. 748
P. Buffat, J. Borel.Phys. Rev. A, 13 (1976), p. 2287
A. Kuksin, et al. Comput. Phys. Commun., 177 (2007), p. 34
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2楼2014-10-29 08:19:55
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荷西树

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2014-10-29 08:19:55
被问到这个问题是正常的，一般来说，模拟的体系是一个没有界面，没有缺陷的理想晶体，因此，会存在过热现象。另外，势函数也会影响模拟的熔点值。

可参考以下文献：

Zhang, S. L. et al. Phys. B Condens. Ma ...

谢谢您
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3楼2014-10-29 12:05:22
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 荷西树 at 2014-10-29 12:05:22
谢谢您...

不客气。建议你用文献中的固液平衡法获得一个接近实验熔点的结果，这样就可以解释审稿人的问题。
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4楼2014-10-29 14:31:19
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