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分子动力学的缺点 已有1人参与
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| 文章一篇分子动力学和实验结合的文章，审稿人纠结在为什么模拟温度跟实验温度不一致。想请大牛帮分析一下分子动力学的缺点或者给几篇文献作为佐证。谢谢 |
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 分子动力学 | 分子模拟 | Materials Studio | 分子模拟 |
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ChemiAndy
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| 我猜 abinitio 的建议大概是这样的，在你所用的力场参数和模拟条件下，该体系的理论模拟熔沸点与实验熔沸点并不对应，因此模拟温度也不必严格与实验温度对应。这是一个很好的point。但是不足以说服审稿人，即你的温差到底是否影响你的定性结论和定量结果。进一步说，好，你说理论与实验熔沸点不一致，那么请你给出对应实验温度的最佳理论温度来？你怎么办？你需要去用模拟该体系的理论熔沸点，然后去找对应点。尽管这才是最严格的方法，但是，我基本没见过去这样做的，为什么？因为太困难了，模拟熔沸点即相变是分子模拟最有挑战的难题之一。所以，大家都不啃声，假装理论熔沸点与实验熔沸点是基本对应的。那按照这个逻辑，你模拟温度就应该与实验温度基本接近。所以，要扯理论熔沸点与实验熔沸点的不一致，是把简单问题复杂化了。不建议去这么回应。 |
7楼2014-10-30 08:31:59
abinitio
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【答案】应助回帖
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|
被问到这个问题是正常的，一般来说，模拟的体系是一个没有界面，没有缺陷的理想晶体，因此，会存在过热现象。另外，势函数也会影响模拟的熔点值。 可参考以下文献： Zhang, S. L. et al. Phys. B Condens. Matter 406, 2637–2641 (2011). L. Han, Q. An, R. Fu, L. Zheng, S. Luo.Phys. B: Condens. Matter, 405 (2010), p. 748 P. Buffat, J. Borel.Phys. Rev. A, 13 (1976), p. 2287 A. Kuksin, et al. Comput. Phys. Commun., 177 (2007), p. 34 |
2楼2014-10-29 08:19:55
3楼2014-10-29 12:05:22
abinitio
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4楼2014-10-29 14:31:19
