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fxh0402

铁虫 (小有名气)

[求助] dmol3算PtRu结构优化失败

我在MS里面导入了Pt晶胞,然后把顶角的Pt原子替换成了Ru原子,然后进行切面111面,2*2的晶胞,4层,固定住了下面两层,参数:use symmetry没有选,spin unrestricted 勾不勾选都是失败,迭代次数设置为500,也挺大了吧?smearing设置为0.009或者0.01也够大了吧?不勾选optimize cell只优化原子,不能再简单了吧?还有没有别的参数修改办法了?怎么办??急!!
Message: SCF not converging. Choose larger smearing value in DMol3 SCF panel or modify/delete ''Occupation Thermal" in the input file. You may also need to change spin or use symmetry.
Resubmit DMol3.
Message : DMol3 job failed
Error : DMol3 exiting
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

smearing可加速收敛,但是也有一定的代价,并且不解决所有问题。
既然Pt和Ru都是50%占据,建议对晶格进行优化,Pt原来的结构是面心立方的结构,替换原子后如果还是这样的结构,我建议拟合三阶B-M方程确定晶格常数,Dmol3本身的优化晶格方法是不准确的。

另外以Ru这样的电子结构截断半径最好大一些,多极展开最好也是大一些(Hex)。至于是否有磁性我不确定,如果有的话最好指定初始自旋态。Pt的表面Dmol3计算确实稍微难收敛一些。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-10-21 11:25:36
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fxh0402

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-10-21 11:25:36
smearing可加速收敛,但是也有一定的代价,并且不解决所有问题。
既然Pt和Ru都是50%占据,建议对晶格进行优化,Pt原来的结构是面心立方的结构,替换原子后如果还是这样的结构,我建议拟合三阶B-M方程确定晶格常数, ...

把smearing设大,有什么代价呢?是结构不可靠吗?但是我发现我的周期平板结构一直没有变化啊。
Pt原来的结构是面心立方的,我把顶角的原子替换为Ru原子,Pt:Ru应该是3:1的
3楼2014-10-22 08:25:11
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卡开发发

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Ab Initio Amateur

引用回帖:
3楼: Originally posted by fxh0402 at 2014-10-22 08:25:11
把smearing设大,有什么代价呢?是结构不可靠吗?但是我发现我的周期平板结构一直没有变化啊。
Pt原来的结构是面心立方的,我把顶角的原子替换为Ru原子,Pt:Ru应该是3:1的...

能量计算不可靠,不信可以看看总能以及外推到0K的能量,这个问题论坛应该有不少人论述过。不管比例吧(上年纪了智商捉鸡了一下),最好考虑晶格结构的弛豫,否则后面优化过程搞不好力难收敛。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-10-22 10:11:09
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fxh0402

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-10-22 10:11:09
能量计算不可靠,不信可以看看总能以及外推到0K的能量,这个问题论坛应该有不少人论述过。不管比例吧(上年纪了智商捉鸡了一下),最好考虑晶格结构的弛豫,否则后面优化过程搞不好力难收敛。...

我是初学者,不是很懂您的意思,您可以说的详细点儿吗?总能是在优化好的.outmol ?OK的能量是单点能energy吗?
还有您说的晶格结构的弛豫怎么考虑呢?
5楼2014-10-23 09:15:41
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卡开发发

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引用回帖:
5楼: Originally posted by fxh0402 at 2014-10-23 09:15:41
我是初学者,不是很懂您的意思,您可以说的详细点儿吗?总能是在优化好的.outmol ?OK的能量是单点能energy吗?
还有您说的晶格结构的弛豫怎么考虑呢?...

如果是采用了合适的smearing,我觉得采用的能量应该取
Df  binding energy extrapolated to T=0K     xxxx Ha      xxxx eV
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
6楼2014-10-23 13:04:11
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卡开发发

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Ab Initio Amateur

引用回帖:
5楼: Originally posted by fxh0402 at 2014-10-23 09:15:41
我是初学者,不是很懂您的意思,您可以说的详细点儿吗?总能是在优化好的.outmol ?OK的能量是单点能energy吗?
还有您说的晶格结构的弛豫怎么考虑呢?...

一般而言smearing的值不宜过大,输出文件中有
Fermi Energy:          -0.190638 Ha      -5.188 eV   -kTS_e= -0.0049465Ha
其中 -kTS_e项最好不要超过1meV/atoms
晶格弛豫如果满足立方晶格,直接做不同晶格长度与能量的曲线来拟合三阶BM方程,具体做法论坛有人讨论。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
7楼2014-10-23 13:06:55
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浴雪飘零_

新虫 (小有名气)

这种情况不优化晶包不好吧

发自小木虫Android客户端
8楼2016-12-10 01:12:56
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