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调整蛋白和配体的相对位置并保存pdb文件
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专业: 生物大分子结构与功能
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调整蛋白和配体的相对位置并保存pdb文件
已有2人参与
请问:
我现在有一个高斯优化的.out的配体文件和一个修饰后的.pdb蛋白文件,现在想把这两个文件整合到一个PDB文件中并且调整相对位置,请问怎样操作或者说用什么软件什么命令呢?主要是调整相对位置然后可以保存为pdb文件,如何调整相对位置呢?谢谢!
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专业: 兽医学
【答案】应助回帖
pymol可以很轻松的搞定这件事情
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3楼
2014-11-05 21:57:56
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