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luowen2012

银虫 (初入文坛)

[求助] 苏云金芽孢杆菌晶体蛋白SDS-PAGE电泳条带不全,模糊不清,急死了 已有1人参与

做的是苏云金芽孢杆菌晶体蛋白的蛋白分析,用的是12%的分离胶和5%的浓缩胶,8%的分离胶也试过了,可是电泳条带还是模糊,而且分离胶上端没有条带,只有靠下面才有条带,脱色效果也,不好不知道哪里出了问题。我的目标蛋白主要是130kD6和65kD的,电泳条件是浓缩胶85V,100mA,分离胶是120V,100mA,电泳时间共4个多小时,用的是北京六一的电泳槽。小弟才开始做电泳不久,麻烦哪位大神帮忙指点一下究竟问题出在哪里啊?不甚感激
1.5 mol/L分离胶缓冲液(pH 8.8):18.15 g Tris,用1 mol/L HCl调节pH至8.8,加水至100 mL,4 ˚C保存。
0.5 mol/L浓缩胶缓冲液(pH 6.8):6 g Tris,用1 mol/L HCl调节pH至6.8,加水至100 mL,4 ˚C保存。

苏云金芽孢杆菌晶体蛋白SDS-PAGE电泳条带不全,模糊不清,急死了
溴酚蓝条带前沿为什么会有有一条粉红色的细线


苏云金芽孢杆菌晶体蛋白SDS-PAGE电泳条带不全,模糊不清,急死了-1
IMG_2524.JPG


苏云金芽孢杆菌晶体蛋白SDS-PAGE电泳条带不全,模糊不清,急死了-2
IMG_2526.JPG
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爱拼才会赢
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pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
luowen2012: 金币+3, 有帮助, 感谢你给我的建议 2014-10-05 16:16:24
你用的是全细胞跑电泳吧,浓度还是太高,可以试试6%,在胶顶部有聚集,分子量大的蛋白没有进入胶带。
还有整个胶有贯穿的拖尾,说明核酸含量太高,建议样品在沸水中5分钟后,离心,然后取上清跑电泳。
长假加班,不容易啊!

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行至水穷处,坐看云起时
2楼2014-10-05 13:44:16
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hwd6218554

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
luowen2012: 金币+3, 有帮助, 非常感谢你的建议和帮助,对我有帮助,听君一席话胜查很多资料 2014-10-05 16:44:18
不知道你是不是从苏云金芽孢杆菌提取的全蛋白,如果是提取的话,看电泳图就是没有裂解好,苏云金芽孢杆菌本身是革兰氏阳性菌细胞壁很厚很难裂解,需要强裂解剂或者溶菌酶。再一个marker怎么也跑的不是很好,电泳时间4个小时太长了,蛋白容易弥散的,再一个你上样孔的地方感觉有样品没进胶,你看一下你的Loading buffer,有没有问题,或者你加的loading buffer够不够,稍微多加点也没关系。
3楼2014-10-05 14:25:36
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luowen2012

银虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by pennchem at 2014-10-05 13:44:16
你用的是全细胞跑电泳吧,浓度还是太高,可以试试6%,在胶顶部有聚集,分子量大的蛋白没有进入胶带。
还有整个胶有贯穿的拖尾,说明核酸含量太高,建议样品在沸水中5分钟后,离心,然后取上清跑电泳。
长假加班, ...

我用的是苏云金芽孢杆菌培养48h后从平板上刮取的菌落提取获得的胞内伴孢晶体蛋白跑的SDS-PAGE的电泳,我的样品在沸水中煮过10分钟了,是样品浓度大了造成的拖尾吗?6%是样品的浓度还是其他的什么意思?
爱拼才会赢
4楼2014-10-05 16:22:10
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luowen2012

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hwd6218554 at 2014-10-05 14:25:36
不知道你是不是从苏云金芽孢杆菌提取的全蛋白,如果是提取的话,看电泳图就是没有裂解好,苏云金芽孢杆菌本身是革兰氏阳性菌细胞壁很厚很难裂解,需要强裂解剂或者溶菌酶。再一个marker怎么也跑的不是很好,电泳时间 ...

我是按照1/2样品体积的量加入的3xLoading buffer,上样水浴加热10-15min,离心后取上清,上样10-15微升,有样品没进入胶是因为样品没有裂解完全的原因吗?分离胶最下面也有分子量小的条带,缩短电泳时间得升高电压了,我分离胶是120V电压,还能在往上升吗?
爱拼才会赢
5楼2014-10-05 16:32:13
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luowen2012

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hwd6218554 at 2014-10-05 14:25:36
不知道你是不是从苏云金芽孢杆菌提取的全蛋白,如果是提取的话,看电泳图就是没有裂解好,苏云金芽孢杆菌本身是革兰氏阳性菌细胞壁很厚很难裂解,需要强裂解剂或者溶菌酶。再一个marker怎么也跑的不是很好,电泳时间 ...

我看文献上提取蛋白时都没有加入强裂解剂或者溶菌酶的,我是镜检发现菌体释放了晶体才停止培养提取蛋白的
爱拼才会赢
6楼2014-10-05 16:35:42
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hwd6218554

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
luowen2012: 金币+3, 有帮助, 谢谢了 2014-10-05 22:24:35
引用回帖:
5楼: Originally posted by luowen2012 at 2014-10-05 17:32:13
我是按照1/2样品体积的量加入的3xLoading buffer,上样水浴加热10-15min,离心后取上清,上样10-15微升,有样品没进入胶是因为样品没有裂解完全的原因吗?分离胶最下面也有分子量小的条带,缩短电泳时间得升高电压 ...

电压调到最大,15mA跑浓缩胶,30mA跑分离胶至溴酚蓝至下边缘。革兰氏阳性菌本身不好裂解的,你只用一步loading buffer煮效果不会太好,要进行前期制备处理,具体请参考相关文献,制备好后用丙酮洗一下蛋白,再溶到1xLoading buffer中煮沸,离心上样。

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7楼2014-10-05 22:01:36
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luowen2012

银虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by hwd6218554 at 2014-10-05 22:01:36
电压调到最大,15mA跑浓缩胶,30mA跑分离胶至溴酚蓝至下边缘。革兰氏阳性菌本身不好裂解的,你只用一步loading buffer煮效果不会太好,要进行前期制备处理,具体请参考相关文献,制备好后用丙酮洗一下蛋白,再溶到 ...

我之前固定电流15mA跑浓缩胶,30mA跑分离胶,两块板一起跑,电泳时间都用了6个小时了;我查了文献都是这样的
苏云金芽孢杆菌晶体蛋白SDS-PAGE电泳条带不全,模糊不清,急死了-3
文献中蛋白样品制备

爱拼才会赢
8楼2014-10-05 23:43:06
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hwd6218554

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
luowen2012: 金币+2, 有帮助, 谢谢了 2014-10-06 10:39:45
两块胶就要翻倍了,30mA/60mA,多查几篇文献进行方法对比,尽量查英文文献。

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2014-10-06 06:26:19
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luowen2012

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by hwd6218554 at 2014-10-06 06:26:19
两块胶就要翻倍了,30mA/60mA,多查几篇文献进行方法对比,尽量查英文文献。

我将电压调到200V,电流为30mA/60mA,电泳过程中电压会超过120V,电泳总的时间也得4个小时才能完成;电泳过程中溴酚蓝条带比之前的宽些
爱拼才会赢
10楼2014-10-06 23:02:13
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