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因研究需要，想弄清楚两种蛋白质之间的相互作用关系，比如发生了什么样的相互作用，哪些力的产生使蛋白质发生交联，哪些基团之间发生了相互作用，以及通过怎样的作用而发生反应，由于只学过简单的生物化学，对分子生物学不是很了解，所以想请教各位虫友，对于上述问题应该如何从实验的角度表征出来，或者有哪些相关书籍、期刊、网站等推荐，如果能推荐两篇相关的高质量综述类文章那就更好啦，先在这里谢谢各位啦 |
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你问的这些问题都很有挑战性啊！如果你手头上有一个好一点的蛋白，那把你问的问题解决了，应该可以写成CNS级别的论文，这时候就不是我们这种小喽啰可以在这里讨论得明白的了。 要搞清楚两个蛋白的相互作用，目前一般是做酵母双杂交或者pull down实验。这些方法都只能证明蛋白是否存在互作，至于互作的细节那就解释不了了，但在生物领域，能知道有无相互作用就已经是一件了不起的事了。蛋白相互作用的细节一般要通过结晶来阐述，有时候一些简单的如磷酸化等可以通过跑胶来判断。有关什么相互作用力使得蛋白发生相互作用这个问题在生物领域还很少考虑，生物系统过于复杂，还有未知的东西太多，因而不能像化学那样把一个反应放到溶液里去评价。 相关基因的相互作用一般是做定量PCR，这是根据蛋白的功能推测哪些基因会受影响，然后挑一些基因出来验证。经费充足一点的实验室通常是做表达谱，或者基因芯片。生物体内的基因调控网络非常复杂，两个看似毫不相关的基因也有可能通过某种联系凑到一起，因而千万不要将化学的那一套简单地移植到生物上来。 相关文献很多，我一时间也不好推荐，毕竟很久没看了。你到cell、nature或science的主页搜索一下，一般有关功能蛋白的研究都会说到相互作用，目前研究的主流也是这方面的。跟你说两个人吧：一个是邓兴旺，他在植物光信号转录因子领域可谓是泰斗级别的人，他发表的有关转录因子的论文同时涉及蛋白-蛋白和蛋白-基因相互作用；另一个清华大学生物院院长施一公，他在结构生物学上可谓是硕果累累，你可以看看他的介绍为论文。 |
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liuderong
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