24小时热门版块排行榜    

查看: 997  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

voleyes

银虫 (正式写手)

[求助] 有没有能够改变蛋白质分子总体构型的软件 已有1人参与

比如我有一个直链形的蛋白质,想把它在视觉效果上弄弯,这个有软件能够操作吗?
如果一点一点的改构型会比较麻烦,因为蛋白质构型很大,不好操作
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

voleyes

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by polypro at 2014-09-24 20:42:16
这个简单,在主链某个位置转一个二面角(PHI或PSI),后面的所有原子都转一下,需要的话我给你一个二面角转的子程序,外加一个循环就行了。

谢谢,程序能否发给我  okakasdu@126.com
3楼2014-09-26 11:49:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

polypro

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
voleyes: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-09-26 11:46:58
这个简单,在主链某个位置转一个二面角(PHI或PSI),后面的所有原子都转一下,需要的话我给你一个二面角转的子程序,外加一个循环就行了。
泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
2楼2014-09-24 20:42:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

polypro

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by voleyes at 2014-09-26 11:49:27
谢谢,程序能否发给我  okakasdu@126.com...

!!rotate atoms from iatom0 to iatom1     
do i=iatom0,iatom1   
        x=xx(i)
        y=yy(i)
        z=zz(i)
        call rotate_matrix2(x,y,z,ax,ay,az,xi,yi,zi,angg)  !C
        xx(i)=x
        yy(i)=y
        zz(i)=z        
     enddo
  subroutine rotate_matrix2(x,y,z,ax,ay,az,xi,yi,zi,an) !rotate (x,y,z) with origin (ax,ay,az) around axis (xi,yi,zi) with angle an
    implicit none
    real x,y,z,ax,ay,az,xi,yi,zi,an
    real r,r12,r23,r13,rcor
    real xr,yr,zr
    real x0,y0,z0    !!only use in test
    integer i,j,k
r=sqrt(xi*xi+yi*yi+zi*zi)
if(r<0.1)goto 101
x0=x
y0=y
x0=z
xi=xi/r
yi=yi/r
zi=zi/r
r12=xi*xi+yi*yi
r23=yi*yi+zi*zi
r13=xi*xi+zi*zi
rcor=xi*x+yi*y+zi*z
xr=ax*r23+xi*(-ay*yi-az*zi+rcor)+((x-ax)*r23+xi*(ay*yi+az*zi-yi*y-zi*z))*cos(an)+(ay*zi-az*yi-zi*y+yi*z)*sin(an)
yr=ay*r13+yi*(-ax*xi-az*zi+rcor)+((y-ay)*r13+yi*(ax*xi+az*zi-xi*x-zi*z))*cos(an)+(-ax*zi+az*xi+zi*x-xi*z)*sin(an)
zr=az*r12+zi*(-ax*xi-ay*yi+rcor)+((z-az)*r12+zi*(ax*xi+ay*yi-xi*x-yi*y))*cos(an)+(ax*yi-ay*xi-yi*x+xi*y)*sin(an)
x=xr
y=yr
z=zr
!if(abs(x)+abs(y)+abs(z)<0.001)then
!   print*,"warning",xi,yi,zi,r,x,y,z,an,x0,y0,z0
!endif
101 continue
  end subroutine rotate_matrix2
泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
4楼2014-09-27 21:07:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +10 Kittylucky 2026-08-27 11/550 2026-08-28 10:45 by Kittylucky
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-28 09:33 by winsaint
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+5) +11 晴天加油 2026-08-26 12/600 2026-08-28 01:22 by li09465290@
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见